Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07403
• Subject: NM_001105250.3
• Aligned Length: 1386
• Identities: 1286
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACCTGAGAATCCACGCGAGACGGAGCCCTCCTCGCCGGCCGGCCTGGACGCTTGGGATCTGGTTCCTGTT  74

Query   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGGGATGTATCGTCAGCTCTGTATGGAGTTCTTCTAATGTAGCTTCCTCCTCCTCCACCTCTTCCTCGCCGG  148

Query  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTCTCACTCTCAGCACGAGCACCATTTCCATGGCAGCAAGCATCACTCAGTGCCTATTTCTATCTATCGTTCC  222

Query  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGTTTCCCTTCGAGGAGGACACGCTGGCGCTACGTACATCTTTGGGAAAAGTGGTGGGCTTATCCTCTACAC  296

Query  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGCCAGCCAATGACAGGCCCAGCACGCGGTCTGACCGCCTTGCCGTGGGCTTCAGCACCACTGTGAAGGATG  370

Query  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATCTTGGTCCGCATCGACAGTGCTCCAGGACTTGGTGACTTCCTCCAGCTTCACATAGAACAGGGGAAAATT  444

Query  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGTTGTCTTCAACATTGGCACAGTTGACATCTCCATCAAAGAGGAGAGAACCCCTGTAAATGACGGCAAATA  518

Query  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCATGTGGTACGCTTCACCAGGAACGGCGGCAACGCCACCCTGCAGGTGGACAACTGGCCAGTGAATGAACATT  592

Query  593  ATCCTAC-------------------------------------------------------------------  599
            |||||||                                                                   
Sbjct  593  ATCCTACAGGCAACACTGATAATGAACGCTTCCAAATGGTAAAACAGAAAATCCCCTTCAAATATAATCGGCCT  666

Query  600  -----------------------AGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGG  650
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTAGAGGAGTGGCTGCAGGAAAAAGGCCGGCAGTTAACCATCTTCAACACTCAGGCGCAAATAGCCATTGGTGG  740

Query  651  AAAGGACAAAGGACGCCTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAGGACAAAGGACGCCTCTTCCAAGGCCAACTCTCTGGGCTCTATTATGATGGTTTGAAAGTACTGAACATGG  814

Query  725  CGGCTGAGAACAACCCCAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGA  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGGCTGAGAACAACCCCAATATTAAAATCAATGGAAGTGTTCGGCTGGTTGGAGAAGTCCCATCAATTTTGGGA  888

Query  799  ACAACACAGACGACCTCCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTAC  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAACACAGACGACCTCCATGCCACCAGAAATGTCTACTACTGTCATGGAAACCACTACTACAATGGCGACTAC  962

Query  873  CACAACCCGTAAGAATCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAACCCGTAAGAATCGCTCTACAGCCAGCATTCAGCCAACATCAGATGATCTTGTTTCATCTGCTGAATGTT  1036

Query  947  CAAGTGATGATGAAGACTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTACAGGTAGGTCAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATC  1020
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAGTGATGATGAAGACTTTGTTGAATGTGAGCCGAGTA---------CAGCAAACCCCACGGAGCCGGGAATC  1101

Query 1021  AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGACGGGTTCCGGGGGCCTCAGAGGTGATCCGGGAGTCGAGCAGCACAACAGGGATGGTCGTCGGCATTGTGGC  1175

Query 1095  TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  TGCTGCCGCCCTCTGCATCTTGATCCTCCTGTACGCCATGTACAAGTACAGGAACAGGGACGAGGGGTCCTATC  1249

Query 1169  AAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  AAGTGGACGAGACGCGGAACTACATCAGCAACTCCGCCCAGAGCAACGGCACGCTCATGAAGGAGAAGCAGCAG  1323

Query 1243  AGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGCATTACGTG  1296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1324  AGCTCGAAGAGCGGCCACAAGAAACAGAAAAACAAGGACAGGGAGTATTACGTG  1377