Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07408
- Subject:
- NM_001328646.2
- Aligned Length:
- 2582
- Identities:
- 2447
- Gaps:
- 112
Alignment
Query 1 ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGT 74
Query 75 CAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCC 148
Query 149 TGTTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGC 222
Query 223 TTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCGCGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCAT 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGTGCGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCAT 296
Query 297 CAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCAC 370
Query 371 TGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATC 444
Query 445 CAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGCCGAACAGCCCCTCGCTGT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 CAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGCCGAGCAGCCCCTCGCTGT 518
Query 519 GGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCT 592
Query 593 CCCAGGACCTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTG 666
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCAGGACCTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTG 666
Query 667 CTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGGTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGCGCCCCCGTGCACTGGTC 740
Query 741 GGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCACA 814
Query 815 GCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGA 888
Query 889 GTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCT 962
Query 963 AGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTC 1036
Query 1037 AGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAA 1110
Query 1111 GAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTC 1184
Query 1185 CTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGA 1258
Query 1259 AGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTAC 1332
Query 1333 AAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGT 1406
Query 1407 CACTGAGAACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACTGAGAACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGAC 1480
Query 1481 TGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAG 1554
Query 1555 GACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTG 1628
Query 1629 GGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATG 1702
Query 1703 AACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAG 1776
Query 1777 TATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCT 1850
Query 1851 GGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGC 1924
Query 1925 GGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCC 1998
Query 1999 ATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCA 2072
Query 2073 GGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCT 2146
Query 2147 TTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTG 2220
Query 2221 CTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCT 2294
Query 2295 CCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCC 2368
Query 2369 TGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAAGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGAC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||||| .|.||..||||.
Sbjct 2369 TGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAA---------GACAGGAA--------TAGCTGGCAGAG 2425
Query 2443 AAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTTTGTGAGC--CTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGGTCTT 2514
..|.||| |.||||||.| |..||| |.|.| ||| ||..|.|||
Sbjct 2426 GGACAGC--------AGATGCCAGA---------GGCAGCAGCAGAG------AGA-ACGGAGATG-------- 2467
Query 2515 GTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCATCCAGTCCTGGCACTCGGACT 2580
|.|||
Sbjct 2468 --GAACA----------------------------------------------------------- 2472