Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07414
• Subject: NM_003417.5
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1879
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA  74

Query   75  GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC  148

Query  149  TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC  222

Query  223  AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG  296

Query  297  TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG  370

Query  371  GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG  444

Query  445  AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA  518

Query  519  GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATACAGTCCATAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG  592
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATAGAGTCCGTAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG  592

Query  593  AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG  666

Query  667  AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT  740

Query  741  GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT  814

Query  815  CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC  888

Query  889  ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG  962

Query  963  CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT  1036

Query 1037  TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC  1110

Query 1111  TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG  1184

Query 1185  AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA  1258

Query 1259  TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG  1332

Query 1333  CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA  1406

Query 1407  CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC  1480

Query 1481  GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA  1554

Query 1555  TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA  1628

Query 1629  ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA  1702

Query 1703  GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG  1776

Query 1777  GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA  1850

Query 1851  CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1881
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1881