Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07427
• Subject: XR_931950.3
• Aligned Length: 2193
• Identities: 1444
• Gaps: 745

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTTCTGCGCCTGCTCCACGTCACTAAACTCGCTACCGCCTGCTCCCCTCCAGAGACCGGGGGCCTTCCAGCAGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTTCGGACCCCCGAGCACAGAGACCGCCAAGCCAAAGGCGAGTAGCAATCCCTCGGTTCGGAAACGGCGAAAGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAACCGCAAGGAGGCCACCACGTCGGGTGGGAGCTACGAAGTTGCCCGTTCCCGGTTACTTCCGGGCTTGCGAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGACGACTGCTCTCAAAGGCCAAACTTAATGGATGGACGAGCAGCGCGCTACTGCAGCTTTCTTCCGCCTTAGG  296

Query    1  ----------------ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCA  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGGTGGCGGCCAGGGATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCA  370

Query   59  CTTTGCATGGTCTCCAGAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAAC  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTGCATGGTCTCCAGAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAAC  444

Query  133  ACCCAGGAGAAGAGCGCCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCTTAGC  206
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  445  ACCCAGGAGAAGAGCGCCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCATAGC  518

Query  207  TTTACGAATATTAAACTGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTT  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTACGAATATTAAACTGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTT  592

Query  281  CACATCACATGGTTTTCAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCC  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACATCACATGGTTTTCAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCC  666

Query  355  TTAATCTTTGCAAGCATTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCC  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTAATCTTTGCAAGCATTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCC  740

Query  429  TAGACTTGCCCAAGCACTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATC  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGACTTGCCCAAGCACTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATC  814

Query  503  AGGAAGTGGCAAGATGGGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTT  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAAGTGGCAAGATGGGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTT  888

Query  577  ACAAACACCATGGAAACTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAA  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAACACCATGGAAACTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAA  962

Query  651  CAGTGTCAAATACTCATCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTT  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTGTCAAATACTCATCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTT  1036

Query  725  TGCTCTTCAGACATTTCTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTT  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCTCTTCAGACATTTCTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTT  1110

Query  799  GTTACTTTGAGTTTGTCTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTT  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTACTTTGAGTTTGTCTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTT  1184

Query  873  GAAATTTAACGTGCTGCAGAACTTGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGAT  946
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAATTTAACGTGCTGCAGAACTGGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGAT  1258

Query  947  TTCCAGTTATCTTGGGTACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATA  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCCAGTTATCTTGGGTACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATA  1332

Query 1021  CTTTTGGTGACTGTGCTGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCC  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTTTGGTGACTGTGCTGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCC  1406

Query 1095  AGTTTTACCATTCTGTATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAA  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1407  AGTTTTACCATTCTGTATGGTGTTCTGT----------------------------------------------  1434

Query 1169  GTTTCCTGTTTTTATCAAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTC  1242
                                                                                      
Sbjct 1435  --------------------------------------------------------------------------  1434

Query 1243  ATGAGTCATATTCAAAAAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTG  1316
                                                                                      
Sbjct 1435  --------------------------------------------------------------------------  1434

Query 1317  CCACTCTACTCCTTATTACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGA  1390
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  --------------------GCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGA  1488

Query 1391  CTGGAAAAAGTCATTATCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTCACATAGAGAGTTT  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1489  CTGGAAAAAGTCATTATCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTTACATAGAGAGTTT  1562

Query 1465  CATGATGATGCATCATTGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGTGCTTTCCTAAT  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1563  CATGATGATGCATCATTGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGCGCTTTCCTAAT  1636

Query 1539  TTCAAGCAATTATAAAAGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATAT  1612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637  TTCAAGCAATTATAAAAGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATAT  1710

Query 1613  ATGTCTATGAACGGAAGTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC------------------------  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 1711  ATGTCTATGAACGGAAGTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTCTGAACTTTCCTAGATAAATTAACA  1784

Query 1663  --------------------------------------------------------------------------  1662
                                                                                      
Sbjct 1785  TTGCTGGGTGGAAATATTCAGATGCTGCTTAAATACTTCGGTAAACACTGGGTAAGATTCATGGAACTTAGAAA  1858

Query 1663  --------------------------------------------------------------------------  1662
                                                                                      
Sbjct 1859  AAAGCTGTATGAACTGCTTTACCAAATATCACTACTGAGGAAATGTATAAAATACCACATAGTATAAAATTACA  1932

Query 1663  -----------------------------------------------  1662
                                                           
Sbjct 1933  TGTTAATACAATGCCAGATTTTAAATAAAGACCTTTAGTTTTCCTCA  1979