Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07468
• Subject: NM_001329494.1
• Aligned Length: 905
• Identities: 598
• Gaps: 283

Alignment

Query   1  ATGGCGAAGGTCTCAGAGCTTTACGATGTCACTTGGGAAGAAATGAGAGATAAAATGAGAAAATGGAGAGAAGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGAAGGTCTCAGAGCTTTACGATGTCACTTGGGAAGAAATGAGAGATAAAATGAGAAAATGGAGAGAAGA  74

Query  75  AAACTCAAGAAATAGTGAGCAAATTGTGGAAGTTGGAGAAGAATTAATTAATGAATATGCTTCTAAGCTGGGAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AAACTCAAGAAATAGTGAGCAAATTGTGGAAGTTGGAGAAGAATTAATTAATGAATATGCTTCTAAGCTGGGAG  148

Query 149  ATGATATTTGGATCATATATGAACAGGTGATGATTGCAGCACTAGACTATGGTCGGGATGACTTGGCATTGTTT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATGATATTTGGATCATATATGAACAGGTGATGATTGCAGCACTAGACTATGGTCGGGATGACTTGGCATTGTTT  222

Query 223  TGTCTTCAAGAGCTGAGAAGACAGTTCCCTGGCAGTCACAGAGTCAAGCGATTAACAGGCATGAGATTTGAAGC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TGTCTTCAAGAGCTGAGAAGACAGTTCCCTGGCAGTCACAGAGTCAAGCGATTAACAGGCATGAGATTTGAAGC  296

Query 297  CATGGAAAGATATGATGATGCTATACAGCTATATGATAGGATTTTACAAGAAGATCCAACTAACACTGCTGCAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATGGAAAGATATGATGATGCTATACAGCTATATGATAGGATTTTACAAGAAGATCCAACTAACACTGCTGCAA  370

Query 371  GAAAGCGTAAGATTGCCATTCGAAAAGCCCAGGGGAAAAATGTGGAGGCCATTCGGGAGCTGAGTGAGTATCTG  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 371  GAAAGCGTAAGATTGCCATTCGAAAAGCCCAGGGGAAAAATGTGGAGGCCATTCGGGAGCTGAATGAGTATCTG  444

Query 445  GAACAATTTGTTGGAGACCAAGAAGCCTGGCATGAACTTGCAGAACTTTACATCAATGAACATGACTATGCAAA  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||.
Sbjct 445  GAACAATTTGTTGGAGACCAAGAAGCCTGGCATGAACTTGCAGAACTTTACATCAATGAACATGA------AAT  512

Query 519  AGCAGCCTTTTGTTTAGAGGAACTAAT--GATGACTAATCCACACAACCACTTATACTGTCAGCAGTATGCTGA  590
           ||                      |||  ||| .||.||.|.||       ||.|..|||  |||      |||
Sbjct 513  AG----------------------AATCAGAT-TCTCATGCGCA-------TTTTCTTGT--GCA------TGA  548

Query 591  AGTTAAGTATACCCAAGGTGGACTTGAAAACCTCGAACT--TTCAAGAAAGTATTTTGCACAGGCATTGAAACT  662
           |      |||             ||   |||||.|..||  |.|.|.|||        ||     |.|||   |
Sbjct 549  A------TAT-------------TT---AACCTTGTTCTCATACTACAAA--------CA-----ACTGA---T  584

Query 663  GAACAACAGAAATATG-AGAGCTTTG---------TTTGGACTTTATATGTCGGCAAGTCATATTGCTTCTAAT  726
           ||..||||||   ||| |||..||||         |.|||.||.|||||           |||.||        
Sbjct 585  GAGAAACAGA---ATGAAGACATTTGTCTATTGTCTGTGGTCTATATAT-----------ATAATG--------  636

Query 727  CCAAAAGCAAGTGCAAAAACGAAAAAGGACAACATGAAATATGCTAGTTGGGCAGCTAGTCAAATAAACAGAGC  800
                                                                                     
Sbjct 637  --------------------------------------------------------------------------  636

Query 801  TTATCAGTTTGCAGGTCGAAGTAAGAAGGAAACCAAATATTCTCTTAAGGCTGTCGAAGACATGTTGGAAACAT  874
                                                                                     
Sbjct 637  --------------------------------------------------------------------------  636

Query 875  TGCAGATCACCCAGTCT  891
                            
Sbjct 637  -----------------  636