Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07469
• Subject: XM_006539296.3
• Aligned Length: 3579
• Identities: 3109
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74

Query   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAGC  148

Query  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGAACACACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCCATAGGAGTTGCAGGCCGT  222

Query  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296

Query  297  AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT  370
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  297  TGGAGGCGGCTATAATACTAGCAAACATCGATGGCCTACAGGGGATAACATTCATGCAGAACACCAGGTACGCT  370

Query  371  CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA  444
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CTATGGATGAATTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAAGGGAGAGCTATGGGCGAGCAGCTCTTGCCA  444

Query  445  GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG  518

Query  519  AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT  592

Query  593  TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG  666

Query  667  GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG  740

Query  741  TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG  814

Query  815  AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC  888

Query  889  CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG  962

Query  963  CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC  1036

Query 1037  CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC  1110

Query 1111  TCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGC  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  TCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAATGCACTTGC  1184

Query 1185  TGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC-------  1251
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||       
Sbjct 1185  TGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGGTATGT  1258

Query 1252  --------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC  1317
                    |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC  1332

Query 1318  CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGTTAC  1391
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333  CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGTCAC  1406

Query 1392  TCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTA  1465
            .||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 1407  GCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTGCTA  1480

Query 1466  ATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTG  1539
            .|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCTTTG  1554

Query 1540  ACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGC  1613
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  ACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCTTGC  1628

Query 1614  ATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG  1687
            .|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG  1702

Query 1688  GTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCAGTC  1761
            ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1703  GTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCAGTC  1776

Query 1762  ATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGGTCT  1835
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGGTCT  1850

Query 1836  TGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCA  1909
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851  TGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGCCCA  1924

Query 1910  ATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTCTTC  1983
            .||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTCTTC  1998

Query 1984  TCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGG  2057
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1999  TCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCTGGG  2072

Query 2058  ATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGA  2131
            |||.||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 2073  ATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCA----------------------------------------------  2100

Query 2132  CTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTT  2205
                                                                                      
Sbjct 2101  --------------------------------------------------------------------------  2100

Query 2206  AGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACC  2279
                                                                                      
Sbjct 2101  --------------------------------------------------------------------------  2100

Query 2280  TCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACA  2353
                                                       |||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2101  -------------------------------------------GGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGATACA  2131

Query 2354  TCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGCAGC  2427
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2132  TCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGCAGC  2205

Query 2428  ACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGA  2501
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 2206  ACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCTGGA  2279

Query 2502  AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCCAAG  2575
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2280  AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTCAAG  2353

Query 2576  ACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT  2649
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354  ACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT  2427

Query 2650  GAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGAATT  2723
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2428  GAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGAATT  2501

Query 2724  TGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGATGT  2797
            ||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2502  TGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGATGT  2575

Query 2798  ATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTTCGG  2865
            |.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||      ||.||||||||.|||
Sbjct 2576  ACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTGCGG  2649

Query 2866  GAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGAATG  2939
            ||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 2650  GAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGAGTG  2723

Query 2940  TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTT  3013
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct 2724  TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACCCGT  2797

Query 3014  ATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAGCTT  3087
            |.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||
Sbjct 2798  ACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAGCTT  2871

Query 3088  CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTCG  3161
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2872  CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGGTCG  2945

Query 3162  TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAA  3235
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2946  TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTGCAA  3019

Query 3236  GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGCACC  3309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3020  GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGCACC  3093

Query 3310  ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGAT  3383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3094  ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAAGAT  3167

Query 3384  GATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTCGTA  3457
            |||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 3168  GATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTCGAA  3241

Query 3458  AGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCC  3531
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 3242  AGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGGCCC  3315

Query 3532  ATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC  3558
            ||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3316  ATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC  3342