Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07484
Subject:
NM_001349181.2
Aligned Length:
975
Identities:
831
Gaps:
120

Alignment

Query   1  ATGACCACAGCAAGGTACCGGCCCACCTGGGACCTGGCCCTCGACCCGCTGGTGTCTTGCAAGCTCTGTCTTGG  74
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACCACAACAAGGTACCGGCCCACCTGGGACCTGGCCCTCGACCCGCTGGTGTCTTGCAAGCTCTGTCTTGG  74

Query  75  GGAGTACCCAGTGGAGCAGATGACAACCATAGCCCAGTGCCAATGCATCTTCTGTACTCTGTGCCTGAAACAGT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GGAGTACCCAGTGGAGCAGATGACAACCATAGCCCAGTGCCAATGCATCTTCTGTACTCTGTGCCTGAAACAGT  148

Query 149  ATGTTGAGCTCTTGATCAAAGAAGGATTAGAAACCGCAATTAGCTGCCCAGATGCTGCCTGCCCTAAACAGGGC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATGTTGAGCTCTTGATCAAAGAAGGATTAGAAACCGCAATTAGCTGCCCAGATGCTGCCTGCCCTAAACAGGGC  222

Query 223  CACCTACAGGAGAACGAGATTGAGTGCATGGTTGCAGCTGAAATTATGCAAAGATATAAAAAGCTACAATTTGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CACCTACAGGAGAACGAGATTGAGTGCATGGTTGCAGCTGAAATTATGCAAAGATATAAAAAGCTACAATTTGA  296

Query 297  AAGAGAGGTGCTGTTTGATCCCTGTCGGACTTGGTGCCCGGCGTCCACCTGCCAAGCTGTGTGTCAGCTCCAGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AAGAGAGGTGCTGTTTGATCCCTGTCGGACTTGGTGCCCGGCGTCCACCTGCCAAGCTGTGTGTCAGCTCCAGG  370

Query 371  ACGTGGGGCTGCAGACCCCCCAGCCAGTGCAGTGCAAAGCCTGCCGTATGGAATTCTGCTCCACCTGCAAAGCC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACGTGGGGCTGCAGACCCCCCAGCCAGTGCAGTGCAAAGCCTGCCGTATGGAATTCTGCTCCACCTGCAAAGCC  444

Query 445  AGCTGGCACCCTGGCCAGGGCTGCCCGGAGACCATGCCGATCACCTTCCTCCCCGGGGAGACCAGTGCTGCTTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AGCTGGCACCCTGGCCAGGGCTGCCCGGAGACCATGCCGATCACCTTCCTCCCCGGGGAGACCAGTGCTGCTTT  518

Query 519  CAAAATGGAAGAAGATGACGCGCCCATCAAGCGCTGCCCCAAGTGCAAAGTCTACATCGAGCGAGACGAAGGCT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CAAAATGGAAGAAGATGACGCGCCCATCAAGCGCTGCCCCAAGTGCAAAGTCTACATCGAGCGAGACGAAGGCT  592

Query 593  GCGCGCAGATGATGTGCAAGAACTGCAAGCACGCCTTCTGCTGGTACTGCCTGGAGTCTCTGGACGATGATTTC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GCGCGCAGATGATGTGCAAGAACTGCAAGCACGCCTTCTGCTGGTACTGCCTGGAGTCTCTGGACGATGATTTC  666

Query 667  CTTCTGATACACTACGATAAGGGACCCTGCCGGAACAAGCTGGGCCACTCCCGGGCATCTGTGATCTGGCATCG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CTTCTGATACACTACGATAAGGGACCCTGCCGGAACAAGCTGGGCCACTCCCGGGCATCTGTGATCTGGCATCG  740

Query 741  GACACAGG--------TTGTGGGCATTTTTGCAGGATTTGGGCTGCT----------------GCTCTTG--GT  788
           ||||||||        .|||...|||...||  |||  .||.||.||                ||||.||  ||
Sbjct 741  GACACAGGGATCCACCCTGTCTCCATCCCTG--GGA--AGGTCTACTCCTCCTTCAAGACCCAGCTCATGCAGT  810

Query 789  GGCCTC--------ACCTTTC-----CTACTCC------------TGG-----------CCACTCC-CTTTGTA  825
           .|||.|        .||||||     ||.||||            |||           ||||||| |||||||
Sbjct 811  AGCCCCTGTGGGAAGCCTTTCTCAGTCTCCTCCTCACCCCACGTTTGGCTGTTGGGAAACCACTCCGCTTTGTA  884

Query 826  CTTTGCTGCAAGTGCAAGTGCAG-----TAAAGGTGACGACGACCCGTTACCCACC------------------  876
           |||| |||         .|||||     .|||.|||.|.|       |.||.|.||                  
Sbjct 885  CTTT-CTG---------ATGCAGGATTACAAATGTGTCTA-------TCACTCCCCGGAATTGAGTATTGGCTC  941

Query 877  -------------  876
                        
Sbjct 942  TGGAGGGCAGAAA  954