Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07496
• Subject: XM_006516547.3
• Aligned Length: 2181
• Identities: 1982
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA  74
            ||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCCGCCGCCTTCGGACATCGTGAAGGTGGCCATAGAATGGCCTGGCGCCTACCCTAAACTCATGGAGATTGA  74

Query   75  TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG  148
            .||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGAAAAAGCCACTGTCTGCCATTATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG  148

Query  149  CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC  222
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CACTGCAGCACGCTGATAGTTCAAACTTCTACATCACAGAAAAGAATCGCAACGAAATAAAAAATGGCACGATC  222

Query  223  CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAATGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATACAGTCATCAAGTATGGATGC  296

Query  297  CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG  370
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CAAGTTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTTACCTTTGCTCAGGAGTTCATAAACCTGG  370

Query  371  ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG  444
            |.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  ATGGCATCTCACTTCTCACTCAGATGGTGGAAAGTGGCACTGAACGATACCAGAAGTTGCAGAAGATTATGAAG  444

Query  445  CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  445  CCCTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACTCTCACAGCCTTTGTGGAGTTGATGGACCACGGCATTGTATCATG  518

Query  519  GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC  592
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GGATACATTCTCAGTGGCCTTCATTAAGAAGATAGCCAGCTTTGTGAACAAGTCTGCCATAGACATCTCAATCC  592

Query  593  TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG  666
            |.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct  593  TCCAGCGGTCCTTGGCCATTCTGGAGTCAATGGTTCTCAACAGTCATGACCTCTACCAAAAGGTAGCCCAGGAG  666

Query  667  ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT  740
            ||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  667  ATCACCATTGGCCAACTCATTCCTCATCTTCAGGGGACAGACCAAGAAATACAAACTTACACCATTGCTGTAAT  740

Query  741  TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC  814
            .||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CAACGCACTTTTCCTCAAAGCTCCTGATGAGAGGAGACAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAGCTGC  814

Query  815  GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT  888
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct  815  GCTACATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCACAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCACACCAGTTATATGTT  888

Query  889  CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG  962
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  CTCCAAGTGCTGACCTTTAACCTTCTGGAAGACAGGATGATGACTAAGATGGACCCCCAGGACCAGGCCCAAAG  962

Query  963  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTCGATGCAGAGTCAGAACCTAATAACAGCAGTGGCAGCATGG  1036

Query 1037  AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAACGCAAGTCCATGTACACTCGGGATTATAAAAAACTTGGCTTCATTAATCACGTCAATCCTGCCATGGAC  1110

Query 1111  TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA  1184
            |||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  TTCACACAGACCCCTCCTGGGATGCTGGCTCTGGACAACATGCTGTATTTCGCTAAGCACCACCAGGATGCATA  1184

Query 1185  CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC  1258
            |||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  CATCCGGATCGTGCTAGAGAACAGCAGCCGAGAAGATAAACATGAGTGCCCCTTCGGCCGCAGCAGTATAGAGC  1258

Query 1259  TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG  1332
            |||||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TGACCAAGATGCTGTGTGAGATCCTCAAAGTGGGCGAGCTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTTCACCCGATG  1332

Query 1333  TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA  1406
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  TTCTTCACCCATGACAGATCTTTTGAGGAATTCTTCTGCATTTGCATTCAACTCCTGAACAAAACATGGAAGGA  1406

Query 1407  AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  AATGAGGGCAACATCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCGCTTACAA  1480

Query 1481  CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC  1554
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAAGCCTAGTTCCCTGGACCAGTTCAAAAGCAAGCTGCAAAACCTGAGCTACACCGAGATCCTGAAAATCCGC  1554

Query 1555  CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA  1628
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  CAGTCTGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCTCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATCCAGCCAGA  1628

Query 1629  AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC  1702
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  AATCTTAGAGCTGATTAAACAGCAGCGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCTC  1702

Query 1703  GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA  1776
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1703  GCCGGAGACAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCACCAAATCACAAGGTCTTACATTATGGCGACTTGGAA  1776

Query 1777  GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT  1850
            |||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  GAGAGCCCCCAAGGAGAAGTGCCCCACGATTCCCTGCAGGACAAATTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCAGTGGT  1850

Query 1851  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTTGCTT  1924

Query 1925  TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG  1998
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925  TCTCCATCTTATACGACTCAAATTGCCAACTGAACTTCATTGCTCCTGATAAGCATGAGTACTGCATCTGGACA  1998

Query 1999  GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG  2072
            |||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1999  GATGGGCTGAATGCACTGCTTGGGAAGGACATGATGAGTGACCTGACACGCAATGACCTGGACACCCTGCTGAG  2072

Query 2073  CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG  2146
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2073  CATGGAGATCAAGCTTCGCCTGCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCGGATGCACCTCCGCCTATCCCCAAGG  2146

Query 2147  AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC  2181
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2147  AACCTAGCAACTATGACTTTGTCTATGACTGTAAC  2181