Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07496
- Subject:
- XM_017315380.1
- Aligned Length:
- 2181
- Identities:
- 1717
- Gaps:
- 288
Alignment
Query 1 ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC 296
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGATGC 8
Query 297 CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG 370
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 9 CAAGTTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTTACCTTTGCTCAGGAGTTCATAAACCTGG 82
Query 371 ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG 444
|.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 83 ATGGCATCTCACTTCTCACTCAGATGGTGGAAAGTGGCACTGAACGATACCAGAAGTTGCAGAAGATTATGAAG 156
Query 445 CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 157 CCCTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACTCTCACAGCCTTTGTGGAGTTGATGGACCACGGCATTGTATCATG 230
Query 519 GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC 592
|||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 231 GGATACATTCTCAGTGGCCTTCATTAAGAAGATAGCCAGCTTTGTGAACAAGTCTGCCATAGACATCTCAATCC 304
Query 593 TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG 666
|.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 305 TCCAGCGGTCCTTGGCCATTCTGGAGTCAATGGTTCTCAACAGTCATGACCTCTACCAAAAGGTAGCCCAGGAG 378
Query 667 ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT 740
||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 379 ATCACCATTGGCCAACTCATTCCTCATCTTCAGGGGACAGACCAAGAAATACAAACTTACACCATTGCTGTAAT 452
Query 741 TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGC 814
.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 453 CAACGCACTTTTCCTCAAAGCTCCTGATGAGAGGAGACAGGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAGCTGC 526
Query 815 GTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTT 888
|.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||
Sbjct 527 GCTACATCATTTTAACACATGTCATCCGAGCACAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCACACCAGTTATATGTT 600
Query 889 CTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGAAGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAG 962
||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 601 CTCCAAGTGCTGACCTTTAACCTTCTGGAAGACAGGATGATGACTAAGATGGACCCCCAGGACCAGGCCCAAAG 674
Query 963 GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 675 GGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTGCTTTCGATGCAGAGTCAGAACCTAATAACAGCAGTGGCAGCATGG 748
Query 1037 AGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGATTATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGAC 1110
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 749 AGAAACGCAAGTCCATGTACACTCGGGATTATAAAAAACTTGGCTTCATTAATCACGTCAATCCTGCCATGGAC 822
Query 1111 TTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGCTCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTA 1184
|||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 823 TTCACACAGACCCCTCCTGGGATGCTGGCTCTGGACAACATGCTGTATTTCGCTAAGCACCACCAGGATGCATA 896
Query 1185 CATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGC 1258
|||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 897 CATCCGGATCGTGCTAGAGAACAGCAGCCGAGAAGATAAACATGAGTGCCCCTTCGGCCGCAGCAGTATAGAGC 970
Query 1259 TGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATG 1332
|||||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 971 TGACCAAGATGCTGTGTGAGATCCTCAAAGTGGGCGAGCTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTTCACCCGATG 1044
Query 1333 TTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGAGTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGA 1406
|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1045 TTCTTCACCCATGACAGATCTTTTGAGGAATTCTTCTGCATTTGCATTCAACTCCTGAACAAAACATGGAAGGA 1118
Query 1407 AATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAA 1480
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1119 AATGAGGGCAACATCTGAAGACTTCAACAAGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCGCTTACAA 1192
Query 1481 CCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAGAGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGC 1554
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1193 CCAAGCCTAGTTCCCTGGACCAGTTCAAAAGCAAGCTGCAAAACCTGAGCTACACCGAGATCCTGAAAATCCGC 1266
Query 1555 CAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGA 1628
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1267 CAGTCTGAGAGGATGAACCAGGAAGATTTCCAGTCTCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATCCAGCCAGA 1340
Query 1629 AATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCC 1702
|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1341 AATCTTAGAGCTGATTAAACAGCAGCGCCTGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCTC 1414
Query 1703 GGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAA 1776
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1415 GCCGGAGACAAGACAAGTTTTGGTATTGTCGGCTTTCACCAAATCACAAGGTCTTACATTATGGCGACTTGGAA 1488
Query 1777 GAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGATTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGT 1850
|||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1489 GAGAGCCCCCAAGGAGAAGTGCCCCACGATTCCCTGCAGGACAAATTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCAGTGGT 1562
Query 1851 GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTT 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1563 GACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAGAGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTTGCTT 1636
Query 1925 TCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAACTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACG 1998
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1637 TCTCCATCTTATACGACTCAAATTGCCAACTGAACTTCATTGCTCCTGATAAGCATGAGTACTGCATCTGGACA 1710
Query 1999 GATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGACATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAG 2072
|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1711 GATGGGCTGAATGCACTGCTTGGGAAGGACATGATGAGTGACCTGACACGCAATGACCTGGACACCCTGCTGAG 1784
Query 2073 CATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGG 2146
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1785 CATGGAGATCAAGCTTCGCCTGCTGGACCTGGAAAACATCCAGATCCCGGATGCACCTCCGCCTATCCCCAAGG 1858
Query 2147 AGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGACTGTAAC 2181
|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1859 AACCTAGCAACTATGACTTTGTCTATGACTGTAAC 1893