Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07509
Subject:
NM_001311107.1
Aligned Length:
711
Identities:
601
Gaps:
85

Alignment

Query   1  MKRCRSDELQQQQGEEDGAGLEDAASHLPGADLRPGETTGANSAGGPTSDAGAAAAPNPGPRSKPPDLKKIQQL  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  SEGSMFGHGLKHLFHSRRRSREREHQTSQDSQQHQQQQGMSDHDSPDEKERSPEMHRVSYAMSLHDLPARPTAF  148
               ||||||||||||||||||||||.||..||.|||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   1  ----MFGHGLKHLFHSRRRSREREHQASQEAQQQQQQQGLSDQDSPDEKERSPEMHRVSYAVSLHDLPARPTAF  70

Query 149  NRVLQQIRSRPSIKRGASLHSSSGGGSSGSSSRRTKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQCRPRSSS  222
           ||||||||||||||||||||||  |||.|   ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  71  NRVLQQIRSRPSIKRGASLHSS--GGSGG---RRAKSSSLEPQRGSPHLLRKAPQDSSLAAILHQHQGRPRSSS  139

Query 223  TTDTALLLADGSNVYLLAEEAEGIGDKVDKGDLVALSLPA--GHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQ  294
           ||||||||||||..||||||||.||||.|||||||||||.  ||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 140  TTDTALLLADGSSAYLLAEEAESIGDKGDKGDLVALSLPSGPGHGDSDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIEHLHQ  213

Query 295  KILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNG  368
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214  KILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLKLANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNG  287

Query 369  PSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNI  442
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288  PSRQPKDVLRDMQQGLKDVGANMRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSADNI  361

Query 443  AHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPKSNALYGAPGNL  516
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 362  AHLKDPMEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGGALGSPRSNTLYGAPGNL  435

Query 517  DALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASM  590
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436  DTLLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEERYRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASM  509

Query 591  EEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI  664
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510  EEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKLELQQQQQQVVQLEGVENANARALLGKFINVILALMAVLLVFVSTI  583

Query 665  ANFITPLMKTRLRITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS  709
           |||||||||||||||||.||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 584  ANFITPLMKTRLRITSTALLLLVLFLLWKHWASLTYLLEHVLLPS  628