Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07509
• Subject: NM_178874.3
• Aligned Length: 2133
• Identities: 1882
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGAAGAGGTGCAGATCGGACGAGCTGCAGCAACAACAGGGCGAGGAGGATGGAGCTGGGCTGGAAGATGCCGC  74
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Sbjct    1  ATGAAGAGGTGCAAATCGGACGAGCTGCAGCAACAGCAGGGCGAGGAGGATGGGGCTGGGATGGAAGACGCTGC  74

Query   75  TTCCCACCTGCCGGGCGCGGACCTCCGGCCTGGGGAGACCACGGGTGCTAACTCTGCTGGCGGGCCAACTTCAG  148
            ||.||..|||||.||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGCCTTCTGCCAGGCGCGGACCTCCGGCATGGGGAGGCCTCGAGTGCTAACTCCGCTGGCGGGCCAACTTCAG  148

Query  149  ACGCCGGCGCTGCCGCGGCGCCCAACCCAGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTG  222
            |.||.||||||||.|.|||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGCTGGCGCTGCGGTGGCACCCAACCCGGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTC  222

Query  223  TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGCCTGAAGCACCTGTTTCACAGCCGCCGCAGGTCACGGGAGAGGGAGCA  296

Query  297  CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG  370
            ||||.||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGCGTCTCAGGAGGCCCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGGGCCTATCCGATCAGGACTCCCCAGATGAGAAGG  370

Query  371  AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC  444
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  371  AACGCTCCCCGGAGATGCACCGCGTCTCCTATGCTGTGTCCCTGCACGACCTGCCTGCCCGACCTACTGCTTTC  444

Query  445  AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG  518
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Sbjct  445  AACCGGGTGTTACAGCAAATCCGCTCCAGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCA---CAGCAGTG----  511

Query  519  CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC  592
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Sbjct  512  --------GCGGGAGCGGTGGTCGCCGTGCCAAGAGCAGCTCCCTGGAGCCACAGCGTGGCAGTCCTCACCTGC  577

Query  593  TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC  666
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.
Sbjct  578  TTCGTAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGGGCCGACCCCGTTCCTCCTCT  651

Query  667  ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG  740
            |||||||||||.||..||||.||||||||.|||||||..|.||||||||||||||||||.||.||..|||||||
Sbjct  652  ACCACCGACACCGCCTTGCTCCTGGCCGATGGCAGCAGTGCGTACCTCCTGGCTGAGGAAGCAGAGAGCATCGG  725

Query  741  GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCC----GCC--GGCCATGGTGACACCGACGGCC  808
            ||||||||..||.||||||||.||.||||||||||||||||||    |||  ||||||||||||.|.||.||.|
Sbjct  726  GGACAAGGGTGACAAGGGAGATCTTGTGGCCCTGAGCCTCCCCTCTGGCCCTGGCCATGGTGACTCTGATGGAC  799

Query  809  CCATCAGCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAG  882
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Sbjct  800  CCATCAGCCTGGATGTGCCAGATGGAGCACCGGACCCCCAGCGAACTAAGGCTGCCATCGAACACCTGCACCAA  873

Query  883  AAGATCCTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCGGAGTATCTGAA  956
            ||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  874  AAGATCTTGAAGATCACTGAGCAGATCAAGATCGAGCAGGAGGCGCGGGATGATAACGTGGCAGAGTACCTGAA  947

Query  957  ACTGGCCAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAG  1030
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  948  GCTGGCCAACAATGCGGACAAGCAGCAGGTGTCGCGCATCAAGCAGGTGTTTGAAAAGAAGAACCAGAAGTCCG  1021

Query 1031  CCCAGACCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGG  1104
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Sbjct 1022  CCCAGACCATCGCCCAGCTGCACAAAAAACTGGAGCACTACCGTCGGCGCCTGAAGGAAATCGAGCAGAATGGG  1095

Query 1105  CCCTCGCGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGC  1178
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||
Sbjct 1096  CCCTCGCGGCAGCCCAAGGATGTGCTACGCGATATGCAGCAAGGGCTGAAGGATGTGGGCGCCAACATGCGTGC  1169

Query 1179  AGGCATCAGCGGCTTTGGGGGTGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCC  1252
            .|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1170  CGGCATTAGTGGCTTCGGGGGTGGTGTGGTGGAGGGTGTCAAGGGCAGTCTTTCCGGCCTCTCGCAAGCTACCC  1243

Query 1253  ACACCGCCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATC  1326
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1244  ACACTGCGGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTCGCCAGCCTCATTCGCAACAAGTTCGGCAGTGCCGACAACATC  1317

Query 1327  GCCCACCTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACT  1400
            ||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1318  GCCCACCTGAAGGACCCCATGGAAGATGGACCCCCTGAAGAGGCAGCCCGGGCGCTGAGTGGCAGTGCCACACT  1391

Query 1401  CGTCTCCAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCA  1474
            .||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1392  GGTGTCCAGCCCCAAGTACGGCAGTGACGATGAATGCTCGAGTGCCAGTGCCAGCTCAGCTGGGGCAGGCAGCA  1465

Query 1475  ACTCTGGGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTG  1548
            ||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|..|||||..|.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1466  ACTCTGGGGCTGGGCCAGGAGGTGCACTGGGAAGCCCGAGATCCAACACTCTTTATGGTGCCCCTGGAAATCTG  1539

Query 1549  GATGCTCTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAA  1622
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Sbjct 1540  GACACTCTGCTGGAGGAACTGCGGGAGATAAAGGAGGGCCAGTCACACCTGGAGGACTCCATGGAGGACTTGAA  1613

Query 1623  GACTCAGCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGG  1696
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Sbjct 1614  GACTCAGCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAAGAAGAGCGCTACAGGTATGAGAGGCTGG  1687

Query 1697  AGGAGCAGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATG  1770
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  AGGAACAGCTGAACGACCTGACTGAGCTTCACCAGAATGAAATGACCAACCTAAAGCAGGAGCTGGCCAGCATG  1761

Query 1771  GAGGAGAAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCG  1844
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Sbjct 1762  GAGGAGAAGGTGGCCTACCAGTCCTACGAGAGGGCCCGGGATATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCG  1835

Query 1845  GGTCACCAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAATGCCAACGCGC  1918
            .||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1836  AGTCACCAAGCTGGAACTGCAGCAGCAGCAGCAGCAAGTGGTGCAGTTAGAAGGTGTGGAGAACGCCAACGCGC  1909

Query 1919  GGGCGCTGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCGTGTCCACCATC  1992
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Sbjct 1910  GCGCCCTGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCACTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTTGTGTCCACCATT  1983

Query 1993  GCCAACTTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTCCTCGTCCTGTT  2066
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Sbjct 1984  GCCAACTTCATCACCCCCCTCATGAAGACGCGCCTCCGGATCACCAGCACCGCCCTCCTGCTCCTCGTCCTCTT  2057

Query 2067  CCTCCTCTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC  2127
            |||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 2058  CCTACTGTGGAAGCACTGGGCCTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCATGTGCTGCTGCCCAGC  2118