Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07509
- Subject:
- XM_005245685.4
- Aligned Length:
- 2127
- Identities:
- 1891
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 ATGAAGAGGTGCAGATCGGACGAGCTGCAGCAACAACAGGGCGAGGAGGATGGAGCTGGGCTGGAAGATGCCGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTCCCACCTGCCGGGCGCGGACCTCCGGCCTGGGGAGACCACGGGTGCTAACTCTGCTGGCGGGCCAACTTCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGCCGGCGCTGCCGCGGCGCCCAACCCAGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------ATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA 62
Query 297 CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG 136
Query 371 AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC 210
Query 445 AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG 284
Query 519 CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC 358
Query 593 TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC 432
Query 667 ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG 506
Query 741 GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA 580
Query 815 GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC 654
Query 889 CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCGGAGTATCTGAAACTGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 655 CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCAGAGTATCTGAAACTGGC 728
Query 963 CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA 802
Query 1037 CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG 876
Query 1111 CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT 950
Query 1185 CAGCGGCTTTGGGGGTGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG 1258
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CAGCGGCTTTGGGGGCGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG 1024
Query 1259 CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC 1098
Query 1333 CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC 1172
Query 1407 CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG 1246
Query 1481 GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT 1320
Query 1555 CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA 1394
Query 1629 GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC 1468
Query 1703 AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG 1542
Query 1777 AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCGGGTCAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCGGGTCAC 1616
Query 1851 CAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAATGCCAACGCGCGGGCGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAATGCCAACGCGCGGGCGC 1690
Query 1925 TGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCGTGTCCACCATCGCCAAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 TGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCGTGTCCACCATCGCCAAC 1764
Query 1999 TTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTCCTCGTCCTGTTCCTCCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 TTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTCCTCGTCCTGTTCCTCCT 1838
Query 2073 CTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC 2127
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 CTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC 1893