Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07509
• Subject: XM_005245686.3
• Aligned Length: 2144
• Identities: 1835
• Gaps: 307

Alignment

Query    1  ATGAAGAGGTGCAGATCGGACGAGCTGCAGCAACAACAGGGCGAGGAGGATGGAGCTGGGCTGGAAGATGCCGC  74
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Sbjct    1  ATGAAGAGGTGCAGATCGGACGAGCTGCAGCAACAACAGGGCGAGGAGGATGGAGCTGGGCTGGAAGATGCCGC  74

Query   75  TTCCCACCTGCCGGGCGCGGACCTCCGGCCTGGGGAGACCACGGGTGCTAACTCTGCTGGCGGGCCAACTTCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCCCACCTGCCGGGCGCGGACCTCCGGCCTGGGGAGACCACGGGTGCTAACTCTGCTGGCGGGCCAACTTCAG  148

Query  149  ACGCCGGCGCTGCCGCGGCGCCCAACCCAGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCCGGCGCTGCCGCGGCGCCCAACCCAGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTG  222

Query  223  TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA  296

Query  297  CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG  370
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Sbjct  297  CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG  370

Query  371  AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC  444
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Sbjct  371  AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC  444

Query  445  AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG  518
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Sbjct  445  AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG  518

Query  519  CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC  592
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Sbjct  519  CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC  592

Query  593  TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC  666
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Sbjct  593  TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC  666

Query  667  ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG  740
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Sbjct  667  ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG  740

Query  741  GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA  814
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Sbjct  741  GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA  814

Query  815  GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC  888
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Sbjct  815  GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC  888

Query  889  CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCGGAGTATCTGAAACTGGC  962
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Sbjct  889  CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCAGAGTATCTGAAACTGGC  962

Query  963  CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA  1036
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Sbjct  963  CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA  1036

Query 1037  CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG  1110
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Sbjct 1037  CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG  1110

Query 1111  CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT  1184
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Sbjct 1111  CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT  1184

Query 1185  CAGCGGCTTTGGGGGTGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG  1258
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Sbjct 1185  CAGCGGCTTTGGGGGCGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG  1258

Query 1259  CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC  1332
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Sbjct 1259  CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC  1332

Query 1333  CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC  1406
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Sbjct 1333  CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC  1406

Query 1407  CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG  1480
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Sbjct 1407  CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG  1480

Query 1481  GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT  1554
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Sbjct 1481  GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT  1554

Query 1555  CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA  1628
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Sbjct 1555  CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA  1628

Query 1629  GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC  1702
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Sbjct 1629  GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC  1702

Query 1703  AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG  1776
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Sbjct 1703  AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG  1776

Query 1777  AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATC-----------------CAGGAGGCCGTGGAGTCC  1833
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Sbjct 1777  AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGCCCCTCTGCCCCTGCAGGAGGCCGTGGAGTCC  1850

Query 1834  TGCCTGACCCGGGTCACCAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAA  1907
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Sbjct 1851  TGCC----------------------------------------------------------------------  1854

Query 1908  TGCCAACGCGCGGGCGCTGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCG  1981
                                                                                      
Sbjct 1855  --------------------------------------------------------------------------  1854

Query 1982  TGTCCACCATCGCCAACTTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTC  2055
                                                                                      
Sbjct 1855  --------------------------------------------------------------------------  1854

Query 2056  CTCGTCCTGTTCCTCCTCTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC  2127
                                                                                    
Sbjct 1855  ------------------------------------------------------------------------  1854