Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07535
• Subject: NM_001003931.3
• Aligned Length: 1620
• Identities: 1599
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGCTCCAAAGCCGAAGCCCTGGGTACAGACTGAGGGCCCTGAGAAGAAGAA  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGCTTTTCTTGGCCATGGCTCCAAAGCCGAAGCCCTGGGTACAGACTGAGGGCCCTGAGAAGAAGAA  74

Query   54  GGGCCGGCAGGCAGGAAGGGAGGAGGACCCCTTCCGCTCCACCGCTGAGGCCCTCAAGGCCATACCCGCAGAGA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCGGCAGGCAGGAAGGGAGGAGGACCCCTTCCGCTCCACCGCTGAGGCCCTCAAGGCCATACCCGCAGAGA  148

Query  128  AGCGCATAATCCGCGTGGATCCAACATGTCCACTCAGCAGCAACCCCGGGACCCAGGTGTATGAGGACTACAAC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCGCATAATCCGCGTGGATCCAACATGTCCACTCAGCAGCAACCCCGGGACCCAGGTGTATGAGGACTACAAC  222

Query  202  TGCACCCTGAACCAGACCAACATCGAGAACAACAACAACAAGTTCTACATCATCCAGCTGCTCCAAGACAGCAA  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCACCCTGAACCAGACCAACATCGAGAACAACAACAACAAGTTCTACATCATCCAGCTGCTCCAAGACAGCAA  296

Query  276  CCGCTTCTTCACCTGCTGGAACCGCTGGGGCCGTGTGGGAGAGGTCGGCCAGTCAAAGATCAACCACTTCACAA  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCTTCTTCACCTGCTGGAACCGCTGGGGCCGTGTGGGAGAGGTCGGCCAGTCAAAGATCAACCACTTCACAA  370

Query  350  GGCTAGAAGATGCAAAGAAGGACTTTGAGAAGAAATTTCGGGAAAAGACCAAGAACAACTGGGCAGAGCGGGAC  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTAGAAGATGCAAAGAAGGACTTTGAGAAGAAATTTCGGGAAAAGACCAAGAACAACTGGGCAGAGCGGGAC  444

Query  424  CACTTTGTGTCTCACCCGGGCAAGTACACACTTATCGAAGTACAGGCAGAGGATGAGGCCCAGGAAGCTGTGGT  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTTTGTGTCTCACCCGGGCAAGTACACACTTATCGAAGTACAGGCAGAGGATGAGGCCCAGGAAGCTGTGGT  518

Query  498  GAAGGTGGACAGAGGCCCAGTGAGGACTGTGACTAAGCGGGTGCAGCCCTGCTCCCTGGACCCAGCCACGCAGA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGTGGACAGAGGCCCAGTGAGGACTGTGACTAAGCGGGTGCAGCCCTGCTCCCTGGACCCAGCCACGCAGA  592

Query  572  AGCTCATCACTAACATCTTCAGCAAGGAGATGTTCAAGAACACCATGGCCCTCATGGACCTGGATGTGAAGAAG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCATCACTAACATCTTCAGCAAGGAGATGTTCAAGAACACCATGGCCCTCATGGACCTGGATGTGAAGAAG  666

Query  646  ATGCCCCTGGGAAAGCTGAGCAAGCAACAGATTGCACGGGGTTTCGAGGCCTTGGAGGCGCTGGAGGAGGCCCT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGCCCCTGGGAAAGCTGAGCAAGCAACAGATTGCACGGGGTTTCGAGGCCTTGGAGGCGCTGGAGGAGGCCCT  740

Query  720  GAAAGGCCCCACGGATGGTGGCCAAAGCCTGGAGGAGCTGTCCTCACACTTTTACACCGTCATCCCGCACAACT  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAGGCCCCACGGATGGTGGCCAAAGCCTGGAGGAGCTGTCCTCACACTTTTACACCGTCATCCCGCACAACT  814

Query  794  TCGGCCACAGCCAGCCCCCGCCCATCAATTCCCCTGAGCTTCTGCAGGCCAAGAAGGACATGCTGCTGGTGCTG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGGCCACAGCCAGCCCCCGCCCATCAATTCCCCTGAGCTTCTGCAGGCCAAGAAGGACATGCTGCTGGTGCTG  888

Query  868  GCGGACATCGAGCTGGCCCAGGCCCTGCAGGCAGTCTCTGAGCAGGAGAAGACGGTGGAGGAGGTGCCACACCC  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGACATCGAGCTGGCCCAGGCCCTGCAGGCAGTCTCTGAGCAGGAGAAGACGGTGGAGGAGGTGCCACACCC  962

Query  942  CCTGGACCGAGACTACCAGCTTCTCAAGTGCCAGCTGCAGCTGCTAGACTCTGGAGCACCTGAGTACAAGGTGA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGGACCGAGACTACCAGCTTCTCAAGTGCCAGCTGCAGCTGCTAGACTCTGGAGCACCTGAGTACAAGGTGA  1036

Query 1016  TACAGACCTACTTAGAACAGACTGGCAGCAACCACAGGTGCCCTACACTTCAACACATCTGGAAAGTAAACCAA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TACAGACCTACTTAGAACAGACTGGCAGCAACCACAGGTGCCCTACACTTCAACACATCTGGAAAGTAAACCAA  1110

Query 1090  GAAGGGGAGGAAGACAGATTCCAGGCCCACTCCAAACTGGGTAATCGGAAGCTGCTGTGGCATGGCACCAACAT  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGGGGAGGAAGACAGATTCCAGGCCCACTCCAAACTGGGTAATCGGAAGCTGCTGTGGCATGGCACCAACAT  1184

Query 1164  GGCCGTGGTGGCCGCCATCCTCACTAGTGGGCTCCGCATCATGCCACATTCTGGTGGGCGTGTTGGCAAGGGCA  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCGTGGTGGCCGCCATCCTCACTAGTGGGCTCCGCATCATGCCACATTCTGGTGGGCGTGTTGGCAAGGGCA  1258

Query 1238  TCTACTTTGCCTCAGAGAACAGCAAGTCAGCTGGATATGTTATTGGCATGAAGTGTGGGGCCCACCATGTCGGC  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTACTTTGCCTCAGAGAACAGCAAGTCAGCTGGATATGTTATTGGCATGAAGTGTGGGGCCCACCATGTCGGC  1332

Query 1312  TACATGTTCCTGGGTGAGGTGGCCCTGGGCAGAGAGCACCATATCAACACGGACAACCCCAGCTTGAAGAGCCC  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACATGTTCCTGGGTGAGGTGGCCCTGGGCAGAGAGCACCATATCAACACGGACAACCCCAGCTTGAAGAGCCC  1406

Query 1386  ACCTCCTGGCTTCGACAGTGTCATTGCCCGAGGCCACACCGAGCCTGATCCGACCCAGGACACTGAGTTGGAGC  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCTCCTGGCTTCGACAGTGTCATTGCCCGAGGCCACACCGAGCCTGATCCGACCCAGGACACTGAGTTGGAGC  1480

Query 1460  TGGATGGCCAGCAAGTGGTGGTGCCCCAGGGCCAGCCTGTGCCCTGCCCAGAGTTCAGCAGCTCCACATTCTCC  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGATGGCCAGCAAGTGGTGGTGCCCCAGGGCCAGCCTGTGCCCTGCCCAGAGTTCAGCAGCTCCACATTCTCC  1554

Query 1534  CAGAGCGAGTACCTCATCTACCAGGAGAGCCAGTGTCGCCTGCGCTACCTGCTGGAGGTCCACCTC  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAGCGAGTACCTCATCTACCAGGAGAGCCAGTGTCGCCTGCGCTACCTGCTGGAGGTCCACCTC  1620