Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07541
- Subject:
- NR_102758.1
- Aligned Length:
- 2276
- Identities:
- 1495
- Gaps:
- 567
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------ATGCCGACTGTCAGCGTGA 19
|||||||||||||||||.|
Sbjct 1 CTCTAGGGTCGCTGAGGCCCCGCATGTGGCGCAGGCGCAGTGTCCACGACTCGCCATGCCGACTGTCAGCGTAA 74
Query 20 AGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGATGAACTATGTTTTGAATTT 93
||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AGCGAGACCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGGACCTACA----------------------------------- 113
Query 94 GGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAGGTAATGTAAAGGCAGCA-G 166
||.|||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||.|||..|||||| || |
Sbjct 114 ---------------------ACTTCTGAAAAGCAAATCATAAGCAAGGAACAAGGTCATGGGAAGGCA-CAGG 165
Query 167 GAGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTCCTGTGTCTGGAAGGATTG 240
|.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 166 GGGCCTCAGATGTTGTGCTTTACAAGATTGACGTCCCTGCCAACAGATACGACCTCCTGTGTCTGGAAGGACTG 239
Query 241 GTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGGTAATGCCTGATGGAAAAAT 314
|.|||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||..|.|||.|.||
Sbjct 240 GCTCGGGGCCTCCAGGTCTTCAAAGAAAGGATCAAAGCTCCGGTATATAAGCGAGTGATGCCCAAGGGAGACAT 313
Query 315 CCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAGCAGTTCTCCGTAATATAA 388
|||.||..||.|||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 314 CCAAAAGCTGGTTATCACAGAAGAGACAGCCAAAGTGCGCCCTTTTGCTGTAGCAGCAGTTCTCCGGAATATCA 387
Query 389 AGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAGAATATTTGCAGGAAAAGA 462
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 388 AGTTCACTAAAGACCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAACTACACCAGAATATCTGCAGGAAAAGA 461
Query 463 GCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTATACTGCAAAGCGTCCTTC 536
||..|||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 462 GCGTTGGTTGCTATTGGAACTCACGACTTGGACACTTTATCAGGCCCATTTACTTACACCGCGAAACGTCCTTC 535
Query 537 AGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGATGAACATATACAAGACTG 610
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGATATCAAATTCAAGCCTCTGAATAAGACCAAGGAGTATACAGCTTGTGAATTAATGAACATATACAAGACTG 609
Query 611 ACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTTATCTATGATAGCAATGGT 684
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 610 ACAACCACCTTAAACATTATTTACATATCATTGAAAGTAAGCCCCTGTATCCAGTTATCTATGACAGCAATGGT 683
Query 685 GTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAATACTAGAAATATTTTTAT 758
||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 684 GTGGTCCTGTCGATGCCTCCGATTATAAATGGGAATCATTCAAAAATAACAGTAAATACTAGGAATATATTTAT 757
Query 759 TGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCACCATGTTCAGTGAATATT 832
|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 758 TGAATGCACAGGGACTGACTTCACTAAAGCAAAAATCGTGCTTGACATTATTGTCACCATGTTCAGTGAACACT 831
Query 833 GTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCACATACCTTTCCAGAATTA 906
||||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||.||||.||||||||||||||||..||||||||||||..|.
Sbjct 832 GTGAAAATCAGTTTACAGTTGAAGCAGTTGAAGTAGTTTCTCCTAATGGAAAATCAAGTACCTTTCCAGAGCTG 905
Query 907 GCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCAGAAAATCT 980
.|||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 906 CCTTACAGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGATTTAATTAACAAGAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCTGCAAATCT 979
Query 981 TGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATCAGATTGAGATTGAAATCC 1054
.|||||.||.|||||||||||||.|.|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 980 CGCCAAGCTCCTGACCAGGATGTGTCTGAAGTCAGAAGTCATAGGTGACGGCAATCAGATTGAGGTTGAAATTC 1053
Query 1055 CTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATTGCTTATGGATATAACAAC 1128
||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1054 CTCCGACCAGAGCAGATGTCATCCATGCATGTGACATTGTGGAGGACGCAGCTATTGCTTATGGCTATAACAAC 1127
Query 1129 ATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAAGCTCACTGAACTTCTCCG 1202
||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.|
Sbjct 1128 ATTCAGATGACTCTGCCGAAAACGTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTCAACAAGCTCACCGAGCTCCTCAG 1201
Query 1203 ACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGATA 1276
||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1202 ACTTGACATGGCTGCGGCTGGCTTCACCGAAGCACTGACTTTTGCTCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGACA 1275
Query 1277 AACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACAGCTGAATTTCAGGTGGCA 1350
|.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1276 AGCTTGGCCTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTGCACATAAGTAATCCTAAAACCGCTGAGTTCCAGGTGGCG 1349
Query 1351 CGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCCCCTTCCACTGAAACTGTT 1424
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1350 CGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTTCTAAAGACCATTGCAGCAAACCGGAAGATGCCCCTTCCTCTCAAACTGTT 1423
Query 1425 TGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACTACAGACATCTCTGTGCTG 1498
|||||||||||||.|||||.|||||||||||...|.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1424 TGAAATCTCTGACGTTGTAGTAAAAGATTCTGGCAAAGATGTAGGTGCGAAAAACTACAGGCATCTCTGTGCTG 1497
Query 1499 TTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATTATGCAGTTGCTCGATGTG 1572
|||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1498 TTTATTACAACAAGACTCCCGGGTTTGAGATCATCCATGGCTTGCTGGACAGAATTATGCAGCTGCTCGATGTG 1571
Query 1573 CCTCCTGGTGAAGACAAG-GGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTTCTTCCCCGGGCGATGTG 1645
|||||||||||.|| ||| |||||.||..||||||||||.||.|.|||..||||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1572 CCTCCTGGTGAGGA-AAGCGGGGGCTACATGATCAAAGCGTCTGCAGGTTCTGCCTTTTTCCCTGGACGGTGTG 1644
Query 1646 CAGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACGTTATCACCAAATTTGAG 1719
|.|||||.||||...|.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1645 CTGAGATCTTTGTTGGAGGTCAAAGCATTGGGAAGCTAGGCGTCCTTCATCCTGATGTTATCACCAAATTTGAG 1718
Query 1720 CTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG-------------------------- 1767
||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1719 CTGACCATGCCCTGTTCCTCTCTGGAAATCAATATTGAGCCCTTTTTGTGAGGTTGGTCTCTGAGTGTCCCTTT 1792
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1793 CTGCTCCTGTGGTGTCCTTCAGCCCTCTTTTACAGCACATATCCATTTGTGCGTTAATGTTTAATAAAGTGAAA 1866
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1867 TGTGCTATCTGACTCCTTGCGTAGCTGCATTAGGCCAGCGTGTGGAACAGCTGGTGTGTATCTGCATGTACCAC 1940
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1941 ATTGGGGAGAGGTGCCCTAGACAGGCAGGGTGAGTTCTGGGAGCGGAAGTTTTGCTTGGCCTTCAGAGTATTGG 2014
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 2015 TTACTTCTGACTCCTCCTGAATAGAAGGAAACAACTCATCAACTAGAACACATGTTGTACAGCCTTAAGCCTTT 2088
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 2089 TCTAAACCTGATAAGTATTAATCAATAAAACATTTTAGGAAAATGTTTTCAGAATCAGTATGACCAAGCAGTGA 2162
Query 1768 -------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 2163 CAACCTTTCAAGTCATCTTTTTTAAGTTGATTTATATGTGAATATATGTGTATCTG 2218
