Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07641
- Subject:
- NM_001009570.2
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1016
- Gaps:
- 612
Alignment
Query 1 ATGATGCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCAGTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TAGATGGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCAGCAAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA 592
|||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------ATGAT-------- 5
Query 593 AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 -------------------------GGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC 54
Query 667 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA 128
Query 741 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA 202
Query 815 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG 276
Query 889 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG 350
Query 963 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC 424
Query 1037 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC 498
Query 1111 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT 572
Query 1185 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC 646
Query 1259 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCTTATGCCAAGGCCTTGGAGATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 647 TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCATATGCCAAGGCCTTGGAGATT 720
Query 1333 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC 794
Query 1407 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG 868
Query 1481 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA 942
Query 1555 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA 1016
Query 1629 C 1629
|
Sbjct 1017 C 1017
