Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07642
• Subject: XM_006513161.2
• Aligned Length: 1605
• Identities: 1429
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCCTTTCCCTTGCACCTGTTAACATCTTTAAGGCAGGAGCTGATGAAGAGAGAGCAGAGACAGCTCG  74
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCCTTTCCCTCGCACCTGTTAATATCTTCAAGGCTGGAGCTGATGAAGAGAGGGCCGAGACAGCTCG  74

Query   75  TCTGACTTCTTTTATTGGTGCCATCGCCATTGGAGACTTGGTAAAGAGCACCTTGGGACCCAAAGGCATGGACA  148
            .|||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CCTGTCGTCGTTTATCGGTGCCATCGCCATTGGAGACTTGGTGAAGAGCACTTTGGGACCGAAGGGCATGGACA  148

Query  149  AAATTCTTCTAAGCAGTGGACGAGATGCCTCTCTTATGGTAACCAATGATGGTGCCACTATTCTAAAAAACATT  222
            |||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  149  AAATTCTCCTAAGCAGTGGACGAGACGCCGCTCTGATGGTGACCAACGACGGTGCTACCATTCTCAAGAACATT  222

Query  223  GGTGTTGACAATCCAGCAGCTAAAGTTTTAGTTGATATGTCAAGGGTTCAAGATGATGAAGTTGGTGATGGCAC  296
            |||||.|||||.||.|||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGTGGACAACCCCGCAGCAAAGGTTCTAGTTGATATGTCAAGGGTTCAAGATGATGAAGTTGGTGATGGCAC  296

Query  297  TACCTCTGTTACCGTTTTAGCAGCAGAATTATTAAGGGAAGCAGAATCTTTAATTGCAAAAAAGATTCATCCAC  370
            ||||||||||||.||.|||||.|||||..|..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  TACCTCTGTTACTGTCTTAGCCGCAGAGCTGCTCCGGGAAGCAGAATCTTTAATTGCAAAAAAGATACATCCAC  370

Query  371  AGACCATCATAGCGGGTTGGAGAGAAGCCACGAAGGCTGCAAGAGAGGCGCTGTTGAGTTCTGCAGTTGATCAT  444
            ||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||.||.||.||.||||||
Sbjct  371  AGACCATCATCTCAGGTTGGAGAGAAGCCACAAAGGCAGCAAGAGAGGCCCTGCTGAGCTCCGCTGTGGATCAT  444

Query  445  GGTTCCGATGAAGTTAAATTCCGTCAAGATTTAATGAATATTGCGGGCACAACATTATCCTCAAAACTTCTTAC  518
            |||||.|||||||..|.||||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  445  GGTTCTGATGAAGCCAGATTCTGGCAGGACTTAATGAACATTGCAGGAACGACATTGTCCTCAAAGCTCCTTAC  518

Query  519  TCATCACAAAGACCACTTTACAAAGTTAGCTGTAGAAGCAGTTCTCAGACTGAAAGGCTCTGGCAACCTGGAGG  592
            |||.|||||.|||||||||||.||..|.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCACCACAAGGACCACTTTACTAAACTGGCCGTGGAAGCGGTTCTCAGACTGAAAGGCTCTGGCAACCTGGAGG  592

Query  593  CAATTCATATTATCAAGAAGCTAGGAGGAAGTTTGGCAGATTCCTATTTAGATGAAGGCTTCCTGTTGGATAAA  666
            |.||||||.|.||||||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||.||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  593  CGATTCATGTCATCAAGAAACTAGGTGGGAGTCTGGCAGACTCCTATCTAGATGAAGGTTTTCTTTTGGATAAA  666

Query  667  AAAATTGGAGTAAATCAACCAAAACGAATTGAAAATGCTAAAATTCTTATTGCAAATACTGGTATGGATACAGA  740
            |||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AAAATTGGAGTAAATCAACCAAAGAGAATTGAAAATGCTAAAATTCTTATTGCAAATACTGGGATGGATACAGA  740

Query  741  CAAAATAAAGATATTTGGTTCCCGGGTAAGAGTTGACTCTACAGCAAAGGTTGCAGAAATAGAACATGCGGAAA  814
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  741  CAAAATAAAGATATTTGGCTCTCGGGTAAGAGTTGATTCCACAGCAAAGGTTGCAGAGATAGAACATGCAGAAA  814

Query  815  AGGAAAAAATGAAGGAGAAAGTTGAACGTATTCTTAAGCATGGAATAAATTGCTTTATTAACAGGCAATTAATT  888
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  AGGAGAAGATGAAGGAGAAAGTTGAACGTATTCTTAAGCATGGAATAAATTGCTTTATTAACAGACAGTTAATT  888

Query  889  TATAATTATCCTGAACAGCTCTTTGGTGCTGCTGGTGTCATGGCTATTGAGCATGCAGATTTTGCAGGTGTGGA  962
            ||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  889  TATAATTACCCTGAACAACTCTTCGGCGCTGCTGGCGTCATGGCTATTGAGCATGCGGATTTCGCAGGTGTGGA  962

Query  963  ACGCCTAGCTCTTGTCACAGGTGGTGAAATTGCCTCTACCTTTGATCACCCAGAACTGGTGAAGCTTGGAAGTT  1036
            .|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCTCGCTCTTGTCACAGGTGGTGAGATTGCCTCTACCTTTGATCACCCAGAACTTGTGAAGCTTGGAAGTT  1036

Query 1037  GCAAACTTATCGAGGAAGTCATGATTGGAGAAGACAAACTCATTCACTTTTCTGGGGTTGCCCTTGGTGAGGCT  1110
            ||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  GCAAACTTATTGAAGAAGTTATGATCGGGGAAGATAAACTCATTCACTTTTCTGGGGTTGCCCTTGGTGAGGCA  1110

Query 1111  TGTACCATTGTTTTGCGTGGTGCCACTCAACAAATTTTAGATGAAGCAGAAAGATCATTGCATGATGCTCTTTG  1184
            ||.||||||||..|.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||.||||..||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCACCATTGTGCTTCGTGGTGCCACTCAGCAAATTCTGGATGAAGCTGAACGATCTCTGCATGATGCTCTTTG  1184

Query 1185  TGTTCTTGCGCAAACTGTAAAGGACTCTAGAACAGTTTATGGAGGAGGCTGTTCTGAGATGTTGATGGCTCATG  1258
            |||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||.|||||||.||||
Sbjct 1185  TGTTCTTGCTCAGACTGTAAAAGATCCTAGAACAGTTTACGGGGGAGGCTGCTCTGAGATGCTGATGGCCCATG  1258

Query 1259  CTGTGACACAGCTTGCCAATAGAACACCAGGCAAAGAAGCTGTTGCAATGGAGTCTTATGCTAAAGCACTGAGA  1332
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 1259  CTGTGACACAGCTTGCCAACAGAACCCCAGGAAAAGAAGCTGTAGCAATGGAGTCGTTTGCAAAAGCCCTGAGA  1332

Query 1333  ATGTTGCCAACCATCATAGCTGACAATGCAGGCTATGACAGTGCAGACCTGGTGGCACAGCTCAGGGCTGCTCA  1406
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 1333  ATGTTGCCGACCATCATAGCCGACAATGCGGGCTATGACAGTGCAGATCTGGTGGCACAGCTCCGAGCTGCTCA  1406

Query 1407  CAGTGAAGGCAATACCACTGCTGGATTGGATATGAGGGAAGGCACCATTGGAGATATGGCTATCCTGGGTATAA  1480
            ||||||||||.|||..|||||||||.|||||||||.||||||.|||||.||.||||||||..|.||||||||||
Sbjct 1407  CAGTGAAGGCCATATAACTGCTGGACTGGATATGAAGGAAGGTACCATCGGCGATATGGCAGTACTGGGTATAA  1480

Query 1481  CAGAAAGTTTTCAAGTGAAGCGACAGGTTCTTCTGAGTGCAGCTGAAGCAGCGGAGGTGATTCTGCGTGTGGAC  1554
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1481  CAGAGAGTTTTCAAGTGAAGCGACAGGTTCTTCTGAGTGCGGCTGAAGCAGCAGAGGTGATCCTGCGAGTGGAC  1554

Query 1555  AACATCATCAAAGCGGCACCCAGGAAACGTGTCCCTGATCACCACCCCTGT  1605
            |||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1555  AACATTATCAAAGCAGCACCAAGGAAACGTGTCCCCGATCACCACCCCTGT  1605