Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: NM_019808.3
• Aligned Length: 1790
• Identities: 1533
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAA  740

Query  741  TACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGC  814
            .||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  CACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGC  814

Query  815  GTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAA  888
            |.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|
Sbjct  815  GCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACA  888

Query  889  GAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAGC  962
            |||||||||...||.|||||.|||||||||||||.|.|.|||||||||||||.|||...|||.||.||.|.|||
Sbjct  889  GAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAATAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGC  962

Query  963  TTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAACTG  1036
            |||..|.|.||||..|.|.|||.|||..||.||||||...||..||||.||...|||..|..|||||....|.|
Sbjct  963  TTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCG  1036

Query 1037  CAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTA  1110
            |.|||||.||||||||||||||||||||..|||   ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.|
Sbjct 1037  CTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCA  1107

Query 1111  CCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGAC  1183
            |||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..|||.|||             | ||.||||.|
Sbjct 1108  CCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGC  1168

Query 1184  AAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATG  1257
            ...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1169  CTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATG  1242

Query 1258  TGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAAT  1330
            ||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1243  TGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAAT  1315

Query 1331  TCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAG  1404
            |.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1316  TTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAG  1389

Query 1405  CTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGC  1478
            ||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  CTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGC  1463

Query 1479  GTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTC  1552
            .|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1464  TTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCC  1537

Query 1553  ACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAA  1626
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||
Sbjct 1538  ACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAA  1611

Query 1627  TTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTC  1700
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1612  TTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTC  1685

Query 1701  AGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTC  1774
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1686  TGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTC  1759

Query 1775  ATTCTGTGAATTTT  1788
            ||||||||||||||
Sbjct 1760  ATTCTGTGAATTTT  1773