Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501741.1
• Aligned Length: 2101
• Identities: 1553
• Gaps: 332

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG-------------------------------  709
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                               
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA  740

Query  710  --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  781
              |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  814

Query  782  AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC  855
            ||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC  888

Query  856  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAAT--------  921
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.||||||||||||        
Sbjct  889  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAATGTAAGCAG  962

Query  922  ---------AACT----------CTCAGGA-------------------GCCTTCTCC-------------GCA  944
                     ||||          ||..|||                   |||||||||             .||
Sbjct  963  GTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTGGAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACA  1036

Query  945  GT-------------------TGGCTTCCTCGGT----------------------------------------  959
            ||                   .||||.||.|.||                                        
Sbjct 1037  GTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGCCACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAGGCTCTTCGGCCCT  1110

Query  960  ---AGCTTCCA--------------CACGGAGCAT---------------GCC---------------------  980
               |.||.|||              |||.|.||||               |||                     
Sbjct 1111  GAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCACTGTGCATCAGCACTGTCCCCAAGCCTCTAGCTCTTTCCTGTCTTCA  1184

Query  981  --------------CGAGAGCCT------------------------GGAC-----AGCC-------CAACC--  1002
                          ||||.|.||                        |.||     ||||       |||||  
Sbjct 1185  GTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTCCACGTTAAGAAGAGCAGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGG  1258

Query 1003  -----TCTGGCAG----ACC--------------AGG--------------GGTTACCA---------------  1024
                 ||||| ||    |||              |||              |||| |||               
Sbjct 1259  CGTCATCTGG-AGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTT-CCAGCAGGCCCTCGGTGG  1330

Query 1025  ---GCCTCACAACTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGG  1095
               |||||....|.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   ||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1331  CTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGT  1401

Query 1096  CCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAA  1169
            ||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..|||.|||         
Sbjct 1402  CCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC---------  1466

Query 1170  CTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGG  1242
                | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1467  ----GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGC  1536

Query 1243  AAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTT  1315
            ||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.||.|
Sbjct 1537  AAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCT  1609

Query 1316  GGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGA  1389
            ||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1610  GGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGA  1683

Query 1390  GCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGG  1463
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  GCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGG  1757

Query 1464  AGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTC  1537
            |||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1758  AGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTC  1831

Query 1538  GGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATA  1611
            |.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1832  GTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATA  1905

Query 1612  TGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACAC  1685
            ||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1906  TGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATAC  1979

Query 1686  TTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGT  1759
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1980  TTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTT  2053

Query 1760  GTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            |.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  GCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  2082