Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07727
• Subject: NM_001363700.2
• Aligned Length: 1116
• Identities: 806
• Gaps: 309

Alignment

Query    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74

Query   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148

Query  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAGGTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAG----  218

Query  223  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAGAGATTCCCATGGGGAAAAATTACAATAAACTGAAAAATACTTTGCGGAA  296
                                                                                      
Sbjct  219  --------------------------------------------------------------------------  218

Query  297  TTTAAATCTCCATACAGTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  370
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  ----------------GTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  276

Query  371  CCACCGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGTGACACATGTACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCTGTTAAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  277  CCACCGCCACAGCCACGATCAT----------------------------------------------------  298

Query  445  GCAAGAAATCCTCCTCCACTGGATGCCAGTGAGCCCTACAATACTGCAAAGGCAATTGCAGAATGGGGTCTGGA  518
                                                                                      
Sbjct  299  --------------------------------------------------------------------------  298

Query  519  TTATGTTGTCCTGACATCTGTGGATCGAGATGATATGCCTGATGGGGGAGCTGAACACATTGCAAAGACCGTAT  592
                                                                                      
Sbjct  299  --------------------------------------------------------------------------  298

Query  593  CATATTTAAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  666
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  ---------------GGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  357

Query  667  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  431

Query  741  GGTTCGTGATCCTCGGGTCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  814
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  GGTTCGTGATCCTCGGGCCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  505

Query  815  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  579

Query  889  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGTTGAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGTTGAAGA  653

Query  963  ATATATTACTCCTGAAAAATTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGAAATGAACTTGGATTTCATTATACTGCAAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  ATATATTACTCCTGAAAAATTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGAAATGAACTTGGATTTCATTATACTGCAAGTG  727

Query 1037  GCCCTTTGGTGCGTTCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAAAAGAAAAACAAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  GCCCTTTGGTGCGTTCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAAAAGAAAAACAAAA  801

Query 1111  GACCTC  1116
            ||||||
Sbjct  802  GACCTC  807