Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07730
• Subject: XM_017026192.1
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1197
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTGTCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCAT  74

Query    1  ----------------------------------ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA  148

Query   41  GTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTG  114
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTG  222

Query  115  ATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGA  188
            ||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.||
Sbjct  223  ATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGA  296

Query  189  AAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---ACAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA  259
            |||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA  370

Query  260  TCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCAGTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTA  323
            ||||||||||||||.||||||||||||.||||   |||||   .|||.|    |||| ||      ||||||..
Sbjct  371  TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT---TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAG  437

Query  324  CAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGG  397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||
Sbjct  438  CAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGG  511

Query  398  TGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAA  471
            |||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAA  585

Query  472  GGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGT  545
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||
Sbjct  586  GGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGT  659

Query  546  GGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGT  619
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  660  GGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGT  733

Query  620  CTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGT  693
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  CTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGT  807

Query  694  CCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTA  767
            |||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||
Sbjct  808  CCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTA  881

Query  768  TAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCA  841
            ||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||||....||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  TAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCA  955

Query  842  CCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGG  915
            ||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGG  1029

Query  916  TCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCC  989
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||
Sbjct 1030  TCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCC  1103

Query  990  GGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTC  1063
            ||.||||||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||...|.|.||.||||||||||
Sbjct 1104  GGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTC  1177

Query 1064  TGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAA  1137
            ||||||||||||||||||...||..||||..||.|||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||
Sbjct 1178  TGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAA  1251

Query 1138  TTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTA  1211
            ||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||.||||||..||||||||.|||||
Sbjct 1252  TTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTA  1325

Query 1212  CCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGCATCC--CTAGG----CCAACACCCC--CA  1277
            |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||  ||.||    |||.|.||||  ||
Sbjct 1326  CCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGA-CCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACA  1398

Query 1278  GGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTAT  1351
                   ||||    |...|.|.|||.|||                   |||..||.||               
Sbjct 1399  -------ACAG----GCCCCACCTCCACAT-------------------CTGCAGGCCC---------------  1427

Query 1352  TTGAGGCTCAG-----------CACAG----------CCAGAGAAGCCTACAAGATGCAGCCGGGAGG  1398
             |||||..|||           |||.|          ||||||            ||     |.||| 
Sbjct 1428  -TGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAG------------TG-----GTGAG-  1476