Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07736
• Subject: XM_011515101.3
• Aligned Length: 1132
• Identities: 872
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCTTTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74

Query   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148

Query  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222

Query  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296

Query  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCA-------------------------------------  333

Query  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444
                                                                                      
Sbjct  334  --------------------------------------------------------------------------  333

Query  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  ------------------------------------------GCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  365

Query  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  439

Query  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  513

Query  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  587

Query  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  661

Query  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  735

Query  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTG-  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  736  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  809

Query  962  -----------------TGATCT----------------------GCAGCCCTGGATCAT-------ATAACCC  989
                             ||||.|                      .|||||     |.||       .|||.||
Sbjct  810  AGTTGGGACTTCCACTATGATGTTGAAAGGAAATGAAGAAAGGAGACAGCC-----TTATTTTGTTCCTAATCC  878

Query  990  CCGTGATGGAA---TTCA--TTGC----------CTTCAAT-----GCAATAGCAG-----CCTGGTG------  1032
            ..|||  ||||   ||||  ||.|          |||||||     | |.||.|||     ||| |||      
Sbjct  879  TGGTG--GGAAAGCTTCAAGTTTCTCAACAGTCTCTTCAATTTGGAG-AGTAACAGTTTGTCCT-GTGACCTCT  948

Query 1033  TATGGAGCAAAAACGAGCTTA-  1053
            .|.|||.|.||.|.||| ||. 
Sbjct  949  GAGGGATCCAAGAAGAG-TTGT  969