Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07736
• Subject: XM_017011707.1
• Aligned Length: 1128
• Identities: 1020
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCTTTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74

Query   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148

Query  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222

Query  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296

Query  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370

Query  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444

Query  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518

Query  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592

Query  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666

Query  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740

Query  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814

Query  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888

Query  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTG-  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  962

Query  962  -----------------TGATCT----------------------GCAGCCCTGGATCAT-------ATAACCC  989
                             ||||.|                      .|||||     |.||       .|||.||
Sbjct  963  AGTTGGGACTTCCACTATGATGTTGAAAGGAAATGAAGAAAGGAGACAGCC-----TTATTTTGTTCCTAATCC  1031

Query  990  CCGTGATGGAA---TTCA--TTGCCTTCA--ATGCAA--TAGCA-GCCTGGTG-------TAT---GGA---GC  1040
            ..|||  ||||   ||||  ||.|  |||  |||..|  ||.|| |||.|.||       |||   .||   ||
Sbjct 1032  TGGTG--GGAAAGCTTCAAGTTTC--TCAACATGGGATCTAACATGCCAGATGGTCTCCCTATTTCAGAATTGC  1101

Query 1041  AA-----AAACGAGCTTA  1053
            ||     ||         
Sbjct 1102  AAGCGTGAA---------  1110