Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07736
• Subject: XR_001744543.1
• Aligned Length: 1395
• Identities: 1028
• Gaps: 351

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGGAGGCCT  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  AGGTGGGCGCGCGTTGCCTAACGACCTTCCGCGCGGACGGTGGGCAGGCGACGGCGGCGTGTGGATGGAGGCCT  74

Query   11  TTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATC  84
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATC  148

Query   85  CTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTACCAAGAGCTTT  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTACCAAGAGCTTT  222

Query  159  TCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC  296

Query  233  AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATCATTCCAATGG  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATCATTCCAATGG  370

Query  307  TATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCCTTGTATT  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCCTTGTATT  444

Query  381  CCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTG  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTG  518

Query  455  TTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTTCACAGCTCGA  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTTCACAGCTCGA  592

Query  529  TATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACT  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACT  666

Query  603  GCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAAAGAGCTGGTT  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAAAGAGCTGGTT  740

Query  677  TGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGAC  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGAC  814

Query  751  CATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGA  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGA  888

Query  825  AATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGATTA  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGATTA  962

Query  899  ATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTG-----------  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  963  ATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGTAGTTGGGACT  1036

Query  962  -------TGATCT----------------------GCAGCCCTGGATCAT-------ATAACCCCCGTGATGGA  999
                   ||||.|                      .|||||     |.||       .|||.||..|||  |||
Sbjct 1037  TCCACTATGATGTTGAAAGGAAATGAAGAAAGGAGACAGCC-----TTATTTTGTTCCTAATCCTGGTG--GGA  1103

Query 1000  A---TTCA--TTGCCTTCAA---------TGCA-----------------------------------------  1018
            |   ||||  ||.|  ||||         ||||                                         
Sbjct 1104  AAGCTTCAAGTTTC--TCAACAGACCTCCTGCAGAGCCCCTGTCCATCTCCTTGTGCCTAAGCTACCACTCCTT  1175

Query 1019  --ATAG---CAG-----CCTGG--TGTATGGA--------GCAAAAACGAG----CTTA---------------  1053
              ||||   |||     |.|||  |.||.|||        |.|.|.|.|||    ||||               
Sbjct 1176  CCATAGTTCCAGGAATACTTGGCTTATAAGGATGCCACAGGAAGACAGGAGGCCTCTTACACTGGATGTGAAGC  1249

Query 1054  --------------------------------------------------------------------------  1053
                                                                                      
Sbjct 1250  TATGTCATGGCACTGGCCAGTTTTGTTCATCTTGGACTCACCAATGGAACTGGCAGATGGCAGATGTCAAAAAT  1323

Query 1054  ---------------------------------------------------------------  1053
                                                                           
Sbjct 1324  GTCCCACAGGGCTGGAGCCCTGCATGTAGTTCTGGGAGCAGCAACAGTGGACAGCTGTTAAGA  1386