Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07740
• Subject: NM_001310655.1
• Aligned Length: 1017
• Identities: 859
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCCCCCCGGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||..||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGAGAACTCAGACAAAGTTCCTATCACCATGGTAGGGCCTGAGGACGTTGAGTTTTGCAGTCCCCCGGC  74

Query   75  GTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCC---AGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTCATTT  145
            ||||.|.||..|.||.||||||||||||   |||||..|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTACACCACCGTCACCGTGAAGCCCTCCGGGAGCCCAACACGGCTGCTCAAGGTAGGAGCTGTGGTCCTCATTT  148

Query  146  CGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACATTTAC  219
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  149  CTGGCGCGGTACTGCTGCTCTTCGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAATGACAATCACATTTAC  222

Query  220  AATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACAACTT  293
            |||||.|||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  223  AATGTTCATTACAGTATGAGTATCAATGGGAAACTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGATGCTGTGAACAACTT  296

Query  294  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACAGGAA  367
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.|||||..|.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGCGGAGCGGAAGAAGCAATTGAAGTCAACGATTTTAAAAATGGCATCACTGGGA  370

Query  368  TTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGCCGTG  441
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||
Sbjct  371  TCCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATCAAAGCACAGGTGAAGGCTCGCATCCCTGAGGTGGGCACAGTG  444

Query  442  ACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTATCTG  515
            |||||.||||||||   |||..||||||||||||||||||||||||..||.||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct  445  ACCAAGCAGAGCAT---CTCTGAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGCTAACTACGAAGAGAACTCGCTGATTTG  515

Query  516  GGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGACCTTC  589
            ||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|..|.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  516  GGTGGCCGTGGACCAGCCTGTGAAGGACAGCAGCTTCTTGAGCTCTAAAATCCTTGAACTCTGTGGCGACCTGC  589

Query  590  CTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAA------------AGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTA  651
            |.||||||||||||||.||.|..||||||||            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  590  CGATTTTCTGGCTTAAGCCCATGTATCCAAAAGCAAATTTCGCAGAAATCCAGAGAGAGAGAAGAGAAGTCGTG  663

Query  652  AGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAA  725
            |||||.|.||.|||..|||||||||.||||||||||||.|.|||.||..|.|||.|||||.||||||||||||.
Sbjct  664  AGAAACAGTGCTCCCTCTACCACAAGAAGACCACACAGCGAACCTCGAGGTAACGCAGGCCCTGGAAGACTGAG  737

Query  726  TAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTT---ATCATCAGGAAG  796
            |||.|.|||||||||||.||||||.||.|||.||.||.|.|||||.|||||.|||||||   |.||.|||||||
Sbjct  738  TAACGGAACCAGACCCAATGTTCAGGACGACGCAGAACCTTTCAACCCTGACAATCCTTACCACCAGCAGGAAG  811

Query  797  GGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACC  870
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  GAGAAAGCATGACATTTGACCCTAGACTGGACCATGAAGGGATCTGCTGTATAGAATGCAGGCGGAGCTACACC  885

Query  871  CACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGC  944
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  886  CACTGCCAGAAGATCTGTGAACCACTGGGAGGCTACTATCCATGGCCTTACAATTACCAAGGATGCCGCTCGGC  959

Query  945  CTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            ||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  960  CTGCAGAGTCGTCATGCCATGCAGCTGGTGGGTGGCCCGCATCTTGGGCATGGTG  1014