Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07740
• Subject: NM_010701.3
• Aligned Length: 1005
• Identities: 859
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCCCCCCGGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||..||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGAGAACTCAGACAAAGTTCCTATCACCATGGTAGGGCCTGAGGACGTTGAGTTTTGCAGTCCCCCGGC  74

Query   75  GTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCC---AGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTCATTT  145
            ||||.|.||..|.||.||||||||||||   |||||..|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTACACCACCGTCACCGTGAAGCCCTCCGGGAGCCCAACACGGCTGCTCAAGGTAGGAGCTGTGGTCCTCATTT  148

Query  146  CGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACATTTAC  219
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  149  CTGGCGCGGTACTGCTGCTCTTCGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAATGACAATCACATTTAC  222

Query  220  AATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACAACTT  293
            |||||.|||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  223  AATGTTCATTACAGTATGAGTATCAATGGGAAACTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGATGCTGTGAACAACTT  296

Query  294  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACAGGAA  367
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.|||||..|.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGCGGAGCGGAAGAAGCAATTGAAGTCAACGATTTTAAAAATGGCATCACTGGGA  370

Query  368  TTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGCCGTG  441
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||
Sbjct  371  TCCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATCAAAGCACAGGTGAAGGCTCGCATCCCTGAGGTGGGCACAGTG  444

Query  442  ACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTATCTG  515
            |||||.||||||||   |||..||||||||||||||||||||||||..||.||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct  445  ACCAAGCAGAGCAT---CTCTGAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGCTAACTACGAAGAGAACTCGCTGATTTG  515

Query  516  GGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGACCTTC  589
            ||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|..|.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  516  GGTGGCCGTGGACCAGCCTGTGAAGGACAGCAGCTTCTTGAGCTCTAAAATCCTTGAACTCTGTGGCGACCTGC  589

Query  590  CTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAATTGTT  663
            |.||||||||||||||.||.|..||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|.||.|
Sbjct  590  CGATTTTCTGGCTTAAGCCCATGTATCCAAAAGAAATCCAGAGAGAGAGAAGAGAAGTCGTGAGAAACAGTGCT  663

Query  664  CCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAACCAG  737
            ||..|||||||||.||||||||||||.|.|||.||..|.|||.|||||.||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct  664  CCCTCTACCACAAGAAGACCACACAGCGAACCTCGAGGTAACGCAGGCCCTGGAAGACTGAGTAACGGAACCAG  737

Query  738  ACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTT---ATCATCAGGAAGGGGAAAGCATGA  808
            |||||.||||||.||.|||.||.||.|.|||||.|||||.|||||||   |.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  738  ACCCAATGTTCAGGACGACGCAGAACCTTTCAACCCTGACAATCCTTACCACCAGCAGGAAGGAGAAAGCATGA  811

Query  809  CATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCAGAAG  882
            ||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  CATTTGACCCTAGACTGGACCATGAAGGGATCTGCTGTATAGAATGCAGGCGGAGCTACACCCACTGCCAGAAG  885

Query  883  ATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAGTCAT  956
            |||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  886  ATCTGTGAACCACTGGGAGGCTACTATCCATGGCCTTACAATTACCAAGGATGCCGCTCGGCCTGCAGAGTCGT  959

Query  957  CATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  960  CATGCCATGCAGCTGGTGGGTGGCCCGCATCTTGGGCATGGTG  1002