Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07740
- Subject:
- XM_011534898.2
- Aligned Length:
- 1092
- Identities:
- 997
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCCTGCACGTCGGGGCAGCGGGACAGATCCCAGGGTGCCCAGGGAGTCTCCAAGTGCCTCACTCCTCCCGC 74
Query 1 -------ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC 67
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCAAACATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC 148
Query 68 CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC 222
Query 142 ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT 215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT 296
Query 216 TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA 370
Query 290 ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA 444
Query 364 GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC 518
Query 438 CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA 592
Query 512 TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC 666
Query 586 CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAA------------AGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATTTTTGCAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT 740
Query 648 GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC 814
Query 722 TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAA 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAA 888
Query 796 GGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACAC 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACAC 962
Query 870 CCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGG 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGG 1036
Query 944 CCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037 CCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTGGGCATGGTG 1092