Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07754
- Subject:
- XM_006523356.2
- Aligned Length:
- 1146
- Identities:
- 979
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
|||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
Query 75 GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA 148
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA 148
Query 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG 222
|||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG 222
Query 223 GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG 296
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG 296
Query 297 CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
Query 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA 444
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA 444
Query 445 CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA 518
||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct 445 CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA 518
Query 519 GA-----AGGCCAATGATGAGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAG 587
|| || ||||.|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.||||||||
Sbjct 519 GACTAGCAG--------TGAGACCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAG 584
Query 588 CCTTCACTTACTGTCCCATGAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAG 661
|||.||||.||||.|||||||.||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.|||| ||
Sbjct 585 CCTGCACTCACTGGCCCATGAGACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AG 656
Query 662 C--TGGCCTTTGTCCAGATGAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGA 733
| ||.||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 657 CAGTGCCCTTTGTCCAGATGGGGATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAA 730
Query 734 AAACTTACGGTTTGAGGAATGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCT 805
||||.||.||||.|||...|||||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.|| || ||||.||
Sbjct 731 AAACCTATGGTTGGAGAGCTGAACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACT 802
Query 806 TAAAAAGTGGACTCAGCTCCCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTT 879
|||..||.||.||||||||||||||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||.
Sbjct 803 TAAGGAGCGGTCTCAGCTCCCTGGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTC 876
Query 880 TTGAAAGATCTGAAATTGATCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGT 953
.||||.||||||||||||.|..||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 877 CTGAAGGATCTGAAATTGGTTGGTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGC 950
Query 954 TGATGATTTTAATAGTACCAGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACC 1027
||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 951 TGATGATTTTAATAGTGCTAGCCATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACC 1024
Query 1028 TTTCTGTGGAAATAGATGACATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAG 1101
||||..|||.|.||||.|||...||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1025 TTTCCATGGGAGTAGAGGACGGGAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAG 1098
Query 1102 CTCAGTGATGTTGCGGATTATCTGGAAGATGTTGCA 1137
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1099 CTCAGTGATGTTGCTGACTATCTGGAAGATGTTGCA 1134