Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07792
• Subject: NM_178633.3
• Aligned Length: 1779
• Identities: 1578
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA  74
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGAGACGCCGCCACTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCCCTCGATTCAAAAGACGAGAA  74

Query   75  TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA  148
            |.|.||.|||||.||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct   75  TCCTGAGAAACATTGCCCACTGACGGTGAACCCCTGGCACATGAAGAAAGCCTTTAAAGTCATGAACGAACTCA  148

Query  149  GAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTG  222
            |||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||..|.|||||||||
Sbjct  149  GAAGTCAAAATCTGCTGTGTGACGTCACGATTGTGGCAGAAGACATGGAGATCCCTGCTCACCGCGTGGTGCTG  222

Query  223  GCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAAT  296
            ||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  GCGGCCTGCAGTCCGTACTTCCACGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGCGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTCGAAT  296

Query  297  AAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAG  370
            |||.|||||.||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  AAAGGAGGTGGACGGCTGGACCCTGAGGATGCTGGTCGATTACGTTTACACGGCAGAGATTCAGGTCACAGAGG  370

Query  371  AAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTT  444
            |.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AGAACGTGCAGGTCCTCCTCCCAGCAGCTGGCCTGCTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACATGCTGTGAATTT  444

Query  445  TTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCT  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  TTAGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGCACAGACCT  518

Query  519  TCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTG  592
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct  519  CCTGAATAAGGCCAACACGTATGCAGAACAACATTTTGCAGATGTCGTACTTAGTGAAGAGTTTCTTAACCTCG  592

Query  593  GCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCA  666
            |||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCATCGAGCAGGTGTGCAGCTTAATCTCCAGTGATAAACTCACCATTTCCTCCGAGGAGAAGGTATTTGAAGCA  666

Query  667  GTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTT  740
            ||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct  667  GTCATCGCCTGGGTAAACCACGATAAGGACGTAAGACAGGAGTTCATGGCTCGGCTCATGGAGCATGTCCGATT  740

Query  741  ACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCA  814
            ||||.|||||||||||||.||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  741  ACCTCTGCTTCCTCGGGAGTACTTGGTGCAGCGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTGAAGAACAGCAGTGCGTGCA  814

Query  815  AAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGG  888
            |||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  815  AAGATTACCTCATTGAAGCCATGAAGTACCACCTGCTGCCGACAGAGCAGCGCATGTTAATGAAGAGCGTGCGG  888

Query  889  ACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCG  962
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCCGCCTGAGGACGCCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTCGGGGGCCAGGCACCAAAGGCTATCCG  962

Query  963  GAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGG  1036
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  963  AAGTGTGGAATGCTACGACTTCAAAGAAGAACGGTGGCACCAGGTGGCAGAGCTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGG  1036

Query 1037  CAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTA  1110
            ||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGGATGGTCTATATGGCTGGGCTGGTCTTTGCTGTTGGTGGCTTCAATGGCTCACTAAGAGTTCGCACTGTA  1110

Query 1111  GATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGC  1184
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||||||||..|.|||||
Sbjct 1111  GATTCCTATGACCCCGTGAAAGACCAGTGGACCAGCGTGGCGAACATGCGAGACCGAAGAAGCACACTTGGAGC  1184

Query 1185  TGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCAT  1258
            .||.|||.|.|||||..|..|.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CGCGGTGCTGAATGGGCTGCTGTACGCCGTGGGGGGCTTTGACGGCAGCACAGGTCTATCGTCTGTGGAAGCAT  1258

Query 1259  ACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTT  1332
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1259  ACAACATAAAATCTAATGAGTGGTTTCATGTCGCCCCAATGAACACGAGGAGGAGCAGTGTGGGTGTTGGCGTT  1332

Query 1333  GTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA  1406
            ||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTGGAGGTTTGCTCTATGCCGTGGGGGGTTACGATGGAGCATCGCGCCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA  1406

Query 1407  TAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGT  1480
            |||||||||..||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAATGCTACTGCAAACGAGTGGACTTACATAGCAGAAATGAGCACCAGACGGAGCGGAGCAGGTGTTGGTGTGT  1480

Query 1481  TAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCC  1554
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  TAAACAACTTATTATATGCTGTAGGAGGTCATGATGGTCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGACCCC  1554

Query 1555  ACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGG  1628
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCACAAATGCCTGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGTGTCTGTGCAGTTAATGG  1628

Query 1629  TCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCG  1702
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 1629  TCTGTTGTATGTTGTCGGAGGAGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCGGTAGAGTATTATAACCCCACCACGG  1702

Query 1703  ATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCA  1776
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703  ATAAATGGACAGTTGTGTCCTCTTGTATGAGCACGGGGAGAAGCTACGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCG  1776

Query 1777  TTA  1779
            |||
Sbjct 1777  TTA  1779