Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07799
- Subject:
- XM_017322124.1
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1004
- Gaps:
- 324
Alignment
Query 1 ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1 ----------------ATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA 58
Query 371 CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC 444
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 59 CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC 132
Query 445 CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT 518
.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 133 AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT 206
Query 519 GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG 592
||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 207 GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG 280
Query 593 CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG 666
||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG 354
Query 667 TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC 740
|||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 355 TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC 428
Query 741 TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG 814
|||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 429 TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG 502
Query 815 ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct 503 ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA 576
Query 889 GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA 962
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA 650
Query 963 CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT----- 1031
.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA 724
Query 1032 -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG 1098
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 725 GCCTCCCGAGCACCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATG 798
Query 1099 GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA 1172
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 799 GGCGGTCACCCAACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTA 872
Query 1173 TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC 1246
|||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 873 TGAGGAGATTGTAGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCC 946
Query 1247 CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA 1320
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CCGTGGACGGCGTCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA 1020
Query 1321 GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA 1394
|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1021 GCCATGCAGGGTCTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTA 1094
Query 1395 TCACCGCCGGGATTTCTGG 1413
.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1095 CCACCGTCGGGACTTCTGG 1113