Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07805
• Subject: NM_014892.4
• Aligned Length: 3813
• Identities: 3811
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAA  74

Query   75  AATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGT  148

Query  149  TTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGA  222

Query  223  CATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTT  296

Query  297  ATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTA  370

Query  371  AGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCC  444

Query  445  AGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGG  518

Query  519  CTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTC  592

Query  593  CTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTG  666

Query  667  CAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGC  740

Query  741  CAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAG  814

Query  815  ACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAAC  888

Query  889  ATTTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGA  962
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGA  962

Query  963  GCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCAC  1036

Query 1037  CATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAA  1110

Query 1111  CAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGC  1184

Query 1185  GGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGT  1258

Query 1259  CTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGG  1332

Query 1333  TCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATC  1406

Query 1407  TAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAA  1480

Query 1481  CCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGC  1554

Query 1555  ATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGT  1628

Query 1629  CATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAG  1702

Query 1703  TTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAG  1776

Query 1777  GAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAG  1850

Query 1851  CCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGC  1924

Query 1925  AGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCT  1998

Query 1999  CCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGG  2072

Query 2073  TTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAG  2146

Query 2147  TGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGT  2220

Query 2221  TCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGA  2294

Query 2295  GCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAA  2368

Query 2369  ATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGA  2442

Query 2443  GTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGG  2516

Query 2517  GATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAA  2590

Query 2591  ATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCA  2664

Query 2665  AATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTAT  2738

Query 2739  CCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAA  2812

Query 2813  GATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTT  2886

Query 2887  CATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGG  2960

Query 2961  AAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAG  3034

Query 3035  GAGATAGAGATTATCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGA  3108
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GAGATAGAGATTACCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGA  3108

Query 3109  GATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGG  3182

Query 3183  AAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTG  3256

Query 3257  GCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTAT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTAT  3330

Query 3331  GGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGG  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGG  3404

Query 3405  TCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  TCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAA  3478

Query 3479  GGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAA  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  GGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAA  3552

Query 3553  AACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  AACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGA  3626

Query 3627  TAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATC  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  TAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATC  3700

Query 3701  CTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAA  3774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  CTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAA  3774

Query 3775  AGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  3813
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775  AGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA  3813