Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07807
- Subject:
- NM_001146026.1
- Aligned Length:
- 1299
- Identities:
- 1091
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG 74
|||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.||..|||||.|||||.|..|
Sbjct 1 ATGAGACCATGGACTTTGGCAGTGACTAAGTGGCCACCTTCTGCCCCTGTGGGTCACTGGCGAGTCTCTACAAG 74
Query 75 ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG 148
.|.|.||||||..||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GCTTAGCAGCAGTCCAGGCCAGCTCTGGGGAA------------------------------------------ 106
Query 149 ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT 222
||||..||.|||||.|.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 107 ---------------------------------GACCATCAAACCTCTCTGTAGAGGAGCACCGAGCCTCAGCT 147
Query 223 CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA 296
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 148 CCTGCCGGCAGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA 221
Query 297 GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 222 AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA 295
Query 371 GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC 444
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 296 GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC 369
Query 445 CTCTGCTGCCTCCCGCCCCC---GCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTA 515
||||||||||||||.||.|| |||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||
Sbjct 370 CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCAGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTA 443
Query 516 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACA 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 444 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACA 517
Query 590 TGGCGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGAC 663
||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 518 TGGCACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAG 591
Query 664 GTGGACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTC 737
.|||||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct 592 ATGGACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTC 665
Query 738 CCCGTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTC 811
.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666 GCCCTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCC 739
Query 812 ACATGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCA 885
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||| ||.||.||||||||.||.
Sbjct 740 ACATGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCG 810
Query 886 CCCCCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGG 959
||.|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||
Sbjct 811 CCGCCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGG 884
Query 960 GCCCACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCG 1033
.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 885 CCCCACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTG 958
Query 1034 AGCGGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAAC 1107
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 959 AGCGGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAAC 1032
Query 1108 CCGGACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCG 1181
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1033 CCTGACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCG 1106
Query 1182 AGTCCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCA 1255
||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1107 AGTCCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCA 1180
Query 1256 TCTGCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG 1296
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1181 TTTGCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG 1221