Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07807
• Subject: NM_001146027.1
• Aligned Length: 1299
• Identities: 951
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA  296
                                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA  53

Query  297  GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct   54  AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA  127

Query  371  GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  128  GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC  201

Query  445  CTCTGCTGCCTCCCGCCCCC---GCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTA  515
            ||||||||||||||.||.||   |||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||
Sbjct  202  CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCAGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTA  275

Query  516  CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACA  589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  276  CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACA  349

Query  590  TGGCGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGAC  663
            ||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  350  TGGCACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAG  423

Query  664  GTGGACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTC  737
            .|||||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct  424  ATGGACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTC  497

Query  738  CCCGTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTC  811
            .||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  498  GCCCTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCC  571

Query  812  ACATGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCA  885
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||   ||.||.||||||||.||.
Sbjct  572  ACATGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCG  642

Query  886  CCCCCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGG  959
            ||.|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||
Sbjct  643  CCGCCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGG  716

Query  960  GCCCACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCG  1033
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  717  CCCCACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTG  790

Query 1034  AGCGGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAAC  1107
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  791  AGCGGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAAC  864

Query 1108  CCGGACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCG  1181
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  865  CCTGACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCG  938

Query 1182  AGTCCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCA  1255
            ||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  939  AGTCCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCA  1012

Query 1256  TCTGCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG  1296
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1013  TTTGCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG  1053