Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07807
- Subject:
- NM_134064.2
- Aligned Length:
- 1296
- Identities:
- 951
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ---------------------ATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA 53
Query 297 GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 54 AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA 127
Query 371 GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC 444
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 128 GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC 201
Query 445 CTCTGCTGCCTCCCGCCCCCGCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTACCC 518
||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..|||||||
Sbjct 202 CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTACCC 275
Query 519 CCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACATGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 276 CCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACATGG 349
Query 593 CGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGACGTG 666
|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||..||
Sbjct 350 CACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAGATG 423
Query 667 GACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTCCCC 740
|||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||.||
Sbjct 424 GACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTCGCC 497
Query 741 GTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTCACA 814
.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 498 CTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCCACA 571
Query 815 TGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCACCC 888
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||| ||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 572 TGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCGCCG 642
Query 889 CCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGGGCC 962
|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||.||
Sbjct 643 CCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGGCCC 716
Query 963 CACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCGAGC 1036
||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 717 CACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTGAGC 790
Query 1037 GGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAACCCG 1110
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 791 GGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAACCCT 864
Query 1111 GACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCGAGT 1184
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 865 GACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCGAGT 938
Query 1185 CCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCATCT 1258
|||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 939 CCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCATTT 1012
Query 1259 GCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG 1296
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1013 GCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG 1050