Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07807
• Subject: XM_006517018.3
• Aligned Length: 1299
• Identities: 1156
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG  74
            |||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.||..|||||.|||||.|..|
Sbjct    1  ATGAGACCATGGACTTTGGCAGTGACTAAGTGGCCACCTTCTGCCCCTGTGGGTCACTGGCGAGTCTCTACAAG  74

Query   75  ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG  148
            .|.|.||||||..||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct   75  GCTTAGCAGCAGTCCAGGCCAGCTCTGGGGAAGCCTTGGCCACGAGGGGCCCCTGGTCAGCCCACCTGCCCAGG  148

Query  149  ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||.||.|.||.||||..||.|||||.|.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  149  ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCTGCTGCCCAGACCATCAAACCTCTCTGTAGAGGAGCACCGAGCCTCAGCT  222

Query  223  CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA  296
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CCTGCCGGCAGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA  296

Query  297  GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  297  AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA  370

Query  371  GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC  444

Query  445  CTCTGCTGCCTCCCGCCCCC---GCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTA  515
            ||||||||||||||.||.||   |||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||
Sbjct  445  CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCAGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTA  518

Query  516  CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACA  589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACA  592

Query  590  TGGCGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGAC  663
            ||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  593  TGGCACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAG  666

Query  664  GTGGACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTC  737
            .|||||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct  667  ATGGACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTC  740

Query  738  CCCGTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTC  811
            .||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  GCCCTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCC  814

Query  812  ACATGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCA  885
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||   ||.||.||||||||.||.
Sbjct  815  ACATGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCG  885

Query  886  CCCCCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGG  959
            ||.|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||
Sbjct  886  CCGCCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGG  959

Query  960  GCCCACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCG  1033
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  960  CCCCACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTG  1033

Query 1034  AGCGGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAAC  1107
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1034  AGCGGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAAC  1107

Query 1108  CCGGACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCG  1181
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1108  CCTGACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCG  1181

Query 1182  AGTCCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCA  1255
            ||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1182  AGTCCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCA  1255

Query 1256  TCTGCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG  1296
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1256  TTTGCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG  1296