Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07807
- Subject:
- XM_011244446.1
- Aligned Length:
- 1299
- Identities:
- 1156
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG 74
|||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.||..|||||.|||||.|..|
Sbjct 1 ATGAGACCATGGACTTTGGCAGTGACTAAGTGGCCACCTTCTGCCCCTGTGGGTCACTGGCGAGTCTCTACAAG 74
Query 75 ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG 148
.|.|.||||||..||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct 75 GCTTAGCAGCAGTCCAGGCCAGCTCTGGGGAAGCCTTGGCCACGAGGGGCCCCTGGTCAGCCCACCTGCCCAGG 148
Query 149 ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT 222
||||||||||||||||||||||||.||.|.||.||||..||.|||||.|.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 149 ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCTGCTGCCCAGACCATCAAACCTCTCTGTAGAGGAGCACCGAGCCTCAGCT 222
Query 223 CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA 296
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CCTGCCGGCAGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA 296
Query 297 GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 297 AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA 370
Query 371 GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC 444
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC 444
Query 445 CTCTGCTGCCTCCCGCCCCC---GCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTA 515
||||||||||||||.||.|| |||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||
Sbjct 445 CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCAGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTA 518
Query 516 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACA 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 519 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACA 592
Query 590 TGGCGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGAC 663
||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 593 TGGCACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAG 666
Query 664 GTGGACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTC 737
.|||||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct 667 ATGGACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTC 740
Query 738 CCCGTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTC 811
.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 GCCCTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCC 814
Query 812 ACATGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCA 885
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||| ||.||.||||||||.||.
Sbjct 815 ACATGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCG 885
Query 886 CCCCCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGG 959
||.|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||
Sbjct 886 CCGCCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGG 959
Query 960 GCCCACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCG 1033
.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 960 CCCCACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTG 1033
Query 1034 AGCGGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAAC 1107
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1034 AGCGGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAAC 1107
Query 1108 CCGGACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCG 1181
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1108 CCTGACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCG 1181
Query 1182 AGTCCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCA 1255
||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1182 AGTCCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCA 1255
Query 1256 TCTGCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG 1296
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1256 TTTGCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG 1296