Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07807
- Subject:
- XM_011244450.1
- Aligned Length:
- 1299
- Identities:
- 951
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ---------------------ATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAACA 53
Query 297 GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 54 AGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACAACCCAAGGCTTCCCTTTGCCTACAA 127
Query 371 GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC 444
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 128 GCCAACACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCACTACCCC 201
Query 445 CTCTGCTGCCTCCCGCCCCC---GCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTA 515
||||||||||||||.||.|| |||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||
Sbjct 202 CTCTGCTGCCTCCCACCTCCGCAGCTGATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTCCCTGGGCCCTACCACACCTA 275
Query 516 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACA 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 276 CCCCCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTTCACCCACCACCGCCAGCCCCACCGCCCCAGCCTACCCACA 349
Query 590 TGGCGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGAC 663
||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 350 TGGCACCGCTTGGGCAGTTTGTGTCCCTGCAGACCCAGCACCCACGTATGCCCCTGCAGCGGCTGGATAACGAG 423
Query 664 GTGGACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTC 737
.|||||||.||.||.|||||||.|.||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct 424 ATGGACCTTCGAGGAGACCAGCACCCCTTGGGTAGCTTCACTTACTCCACCTCTGCCACTGGCCCAGCCTTGTC 497
Query 738 CCCGTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTC 811
.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 498 GCCCTCAGTGCCCCTTCACTACCTACCCCATGATCCACTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCCC 571
Query 812 ACATGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCA 885
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||| ||.||.||||||||.||.
Sbjct 572 ACATGATGCCACGAAGACTGAGCACACAGAGATACCGCCTGCAACAGCCGCTG---CCACCACCCCCACCGCCG 642
Query 886 CCCCCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGG 959
||.|||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|..||||
Sbjct 643 CCGCCACCATCTTACTACCCAAGCTTCCTACCCTACTTCCTTTCAATGCTGCCAATGTCACCGACCACCGTGGG 716
Query 960 GCCCACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCG 1033
.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 717 CCCCACCATCAGCTTGGACCTGGACGTGGATGACGTAGAGATGGAGAACTATGAGGCTCTCCTGAACCTGGCTG 790
Query 1034 AGCGGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAAC 1107
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 791 AGCGGCTGGGAGACGCCAAGCCCCGGGGCCTCACCAAAGCAGACATCGAACAACTGCCGTCGTATCGCTTTAAC 864
Query 1108 CCGGACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCG 1181
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 865 CCTGACAGCCATCAGTCTGAGCAGACTCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGTGCGGCAACTGCTCCG 938
Query 1182 AGTCCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCA 1255
||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 939 AGTCCTCCCCTGCAACCACGAGTTCCATGCCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACCTGTCCCA 1012
Query 1256 TCTGCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG 1296
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1013 TTTGCCGGGCGGATGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCCGAG 1053