Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07807
Subject:
XM_011534467.2
Aligned Length:
1296
Identities:
1052
Gaps:
243

Alignment

Query    1  ATGCGACCATGGGCTCTGGCAGTGACTAGGTGGCCACCCTCCGCCCCCGTGGGCCAGCGGCGATTCTCTGCGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCTGGCAGCACCCCGGGCCAGCTCTGGGGAAGCCCTGGCCTCGAGGGCCCCCTGGCCAGCCCGCCTGCCCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAGCGCTTACCCTCCCAGCAGCCGCCGTCCCGACCTCCACACCTCCCCGTAGAGGAGCGCCGAGCCTCGGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTGCCGGCGGGAGCCCCCGAATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA  296
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTGCACCCAGCCACCCAGCAGAGCCCGTTCATGGTTGATCTCCACGAGCA  53

Query  297  GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  GGTGCACCAGGGACCTGTCCCTCTGTCCTACACGGTCACCACAGTGACGACCCAAGGCTTCCCCTTGCCTACAG  127

Query  371  GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  GCCAGCACATCCCTGGCTGCAGTGCCCAGCAGCTCCCAGCATGCTCCGTGATGTTCAGTGGGCAGCATTACCCC  201

Query  445  CTCTGCTGCCTCCCGCCCCCGCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CTCTGCTGCCTCCCGCCCCCGCTTATCCAGGCGTGCACCATGCAGCAGCTGCCTGTGCCCTATCAGGCCTACCC  275

Query  519  CCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACATGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  CCACCTCATCTCCAGTGACCACTACATCCTGCACCCCCCACCACCGGCCCCACCCCCCCAGCCCACCCACATGG  349

Query  593  CGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGACGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  CGCCCCTGGGGCAGTTTGTGTCTCTGCAGACCCAGCACCCTCGGATGCCCCTCCAGCGGCTCGACAACGACGTG  423

Query  667  GACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTCCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GACCTGCGTGGGGACCAGCCCTCCCTGGGCAGCTTCACCTACTCCACCTCTGCGCCTGGCCCAGCCCTTTCCCC  497

Query  741  GTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  GTCGGTGCCCCTGCACTACCTGCCCCACGATCCGCTGCACCAGGAGCTGTCCTTTGGTGTGCCATATTCTCACA  571

Query  815  TGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCACCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  TGATGCCACGGAGACTGAGCACCCAGAGATACCGCCTGCAGCAGCCACTGCCCCCGCCGCCCCCACCCCCACCC  645

Query  889  CCACCTCCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGGGCC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CCACCACCCTACTACCCCAGCTTCCTGCCCTACTTCCTCTCGATGCTGCCAATGTCACCAACAGCAATGGGGCC  719

Query  963  CACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCGAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CACCATCAGCCTGGACCTGGACGTGGATGATGTGGAGATGGAGAACTATGAGGCCCTCCTGAACCTGGCCGAGC  793

Query 1037  GGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAACCCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GGCTGGGAGATGCCAAGCCCCGGGGTCTCACCAAAGCAGACATAGAGCAGCTCCCGTCGTACCGCTTTAACCCG  867

Query 1111  GACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCGAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  GACAGCCATCAGTCGGAGCAGACGCTGTGTGTGGTCTGCTTCAGTGACTTCGAGGCGCGGCAGCTGCTCCGAGT  941

Query 1185  CCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCATCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  CCTCCCCTGCAACCATGAGTTCCACACCAAGTGTGTTGACAAGTGGTTGAAGGCCAACCGGACGTGTCCCATCT  1015

Query 1259  GCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  GCCGGGCCGACGCCTCCGAGGTGCCCAGGGAGGCTGAG  1053