Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07819
- Subject:
- NM_001195604.2
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 962
- Gaps:
- 213
Alignment
Query 1 ATGTCTACGCGGGAGTCCTTTAACCCGGAAAGTTACGAATTGGACAAAAGCTTCCGGCTAACCAGATTCACTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTACGCGGGAGTCCTTTAACCCGGAAAGTTACGAATTGGACAAAAGCTTCCGGCTAACCAGATTCACTGA 74
Query 75 ACTGAAGGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTGCAAAAATTGCTGGAATCTTTACAGGAGAACCACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGAAGGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTGCAAAAATTGCTGGAATCTTTACAGGAGAACCACT 148
Query 149 TCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCCGTTATGCCAAGGCTTGGCATTGGAATGGATACTTGTGTCATTCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCCGTTATGCCAAGGCTTGGCATTGGAATGGATACTTGTGTCATTCCT 222
Query 223 TTGAGGCACGGTGGGCTTTCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGAGGCACGGTGGGCTTTCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGAT 296
Query 297 GGGCAGGATAGCGTGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGACAATATGCTGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGCAGGATAGCGTGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGACAATATGCTGA 370
Query 371 TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTGATGCCTCTGATTATCCAAGGTTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTGATGCCTCTGATTATCCAAGGTTTT 444
Query 445 AAAGACGCAGCTGAGGAAGCAGGAACGTCTGTAACAGGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGG 518
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGACGCAGCTGAGGAAGCAGGAACATCTGTAACAGGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGG 518
Query 519 AGGAGTGGCTACCACTGTCTGCCAACCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGAGTGGCTACCACTGTCTGCCAACCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGG 592
Query 593 TGCTGACAAAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATCCCTGAGAAATGGAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTGACAAAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATCCCTGAGAAATGGAAT 666
Query 667 AAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCGATGATGAACATGGCGAGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCGATGATGAACATGGCGAGGCT 740
Query 741 CAACAGGACAGCTGCAGGACTCATGCACACGTTCAATGCCCACGCCGCCACTGACATCACGGGCTTCGGGATTT 814
||||||||
Sbjct 741 CAACAGGA------------------------------------------------------------------ 748
Query 815 TGGGCCATGCGCAGAACCTGGCCAAGCAGCAGAGGAACGAGGTGTCGTTTGTAATTCACAACCTCCCGGTGCTG 888
Sbjct 749 -------------------------------------------------------------------------- 748
Query 889 GCCAAGATGGCTGCGGTGAGCAAGGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTCATGCACGGGACCTGCCCGGAGACTTC 962
|
Sbjct 749 -------------------------------------------------------------------------C 749
Query 963 AGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATAAAGTCCCCCAAATATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 AGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATAAAGTCCCCCAAATATG 823
Query 1037 GTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGAATCATAGACAAACCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 GTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGAATCATAGACAAACCC 897
Query 1111 CGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCCACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCCACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT 963