Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07831
- Subject:
- XM_024449518.1
- Aligned Length:
- 2259
- Identities:
- 1587
- Gaps:
- 672
Alignment
Query 1 ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGCGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGGCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAATCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGTAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----ATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC 70
Query 371 TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC 144
Query 445 TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC 218
Query 519 ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT 292
Query 593 GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA 366
Query 667 TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAA---------------------------- 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAATTCTCTCAGGCCAGGCACACCACAGCCC 440
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 441 TTTGAAACGATCTGTGTCCCTTACCCCACCCATGAATGTGCCAAACCAGCCTCTAGGACATGGATGGATGTCTC 514
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 515 ATGAGGACTTACGAGCTAGAGGACCCCAGTGCCTCCCATCCGATCATGCCCCCCTGTCTCCACAAAGCAGTGTA 588
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 589 GCCTCTTCAGGAAGTGGTGGGAGTGAACACTTAGAAGATCAGACCACTGCTCGTAACACATTCCAAGAAGAAGG 662
Query 713 --------------ATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGA 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 TAGTGGGATGAAAGATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGA 736
Query 773 TGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACAC 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 TGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACAC 810
Query 847 AAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGA 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 AAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGA 884
Query 921 GGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCC 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 GGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCC 958
Query 995 CGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGC 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGC 1032
Query 1069 CAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGG 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 CAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGG 1106
Query 1143 GCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCG 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 GCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCG 1180
Query 1217 GGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGT 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 GGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGT 1254
Query 1291 TCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTC 1328
Query 1365 ATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGAC 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 ATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGAC 1402
Query 1439 AGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGA 1512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 AGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGA 1476
Query 1513 CGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGG 1586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 CGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGG 1550
Query 1587 ATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGT 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 ATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGT 1624
Query 1661 TTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCC 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 TTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCC 1698
Query 1735 GTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCC--------------------------------- 1775
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 GTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGGTTCCCAAGTTCACAGTGGACTGTGTTTAAC 1772
Query 1776 -------------------------------------------------------------------------- 1775
Sbjct 1773 AGACCTTAGAGGTTGGTTGAGCCTGAGTGGAGCCCCTTCCATGCCAGCGCTGACAGTCCCCAAGTCCTCCCAGG 1846
Query 1776 -AGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAA 1848
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 GAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAA 1920
Query 1849 CACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1887
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1959