Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07845
Subject:
NM_001111304.1
Aligned Length:
1266
Identities:
1214
Gaps:
2

Alignment

Query    1  MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILYQTPDSLV  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHGGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILYQTPDSLV  74

Query   75  YWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKF  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  YWTIACGGSRKEVTEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDVTTFVRGKIQGIIAEYNKINDVKEDEDTEKFKEAIVKF  148

Query  149  HRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIK  222
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  149  HRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWMYLSINHLCFSSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDMIK  222

Query  223  VSTRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYR  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  VSTRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKKKSPKKVSALKRDLDARAKSERYR  296

Query  297  ALFRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  ALFRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKADSCSVLPSPL  370

Query  371  SISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  SISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSRIYSDKEFSGSCNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD  444

Query  445  GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPE  518
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GERPFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPE  518

Query  519  SMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAF  592
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEGLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAF  592

Query  593  RNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQD  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  RNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQD  666

Query  667  LGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDS  740

Query  741  VTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVR  814
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Sbjct  741  VTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVGPYPAVDIFRLIGTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVR  814

Query  815  TIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSD  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  TIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFVLLFPWACGTHSD  888

Query  889  VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDITP  962
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Sbjct  889  VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSCDQDEPDSAFEATQYFFEDITP  962

Query  963  ECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTM  1036
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Sbjct  963  ECTHVVGLDSRGKQSADDGFVTVSLKQDRGKRANSQENRNYLKLWTAENKSKSKTAKDLPKLNQGQFIELCKTM  1036

Query 1037  YNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESV  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||  ....||.|.|.|||.||||||..|.|||||.
Sbjct 1037  YNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKFFITQPAKE--DAVPGPPCGQAIPGMLFPKKGSSQSYVVEST  1108

Query 1111  EPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIG  1184
            |||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  EPLTASLAVDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIG  1182

Query 1185  EDTVLVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASD  1258
            ||||||||.||.|.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1183  EDTVLVRSSQGRATLPRSSSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVRYFDKPVCMMARVTSAKNIRMMGKPLTSASD  1256

Query 1259  YEISAMSG  1266
            |||||.||
Sbjct 1257  YEISALSG  1264