Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07845
Subject:
NM_027758.4
Aligned Length:
1266
Identities:
986
Gaps:
235

Alignment

Query    1  MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILYQTPDSLV  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHGGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILYQTPDSLV  74

Query   75  YWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKF  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||                            
Sbjct   75  YWTIACGGSRKEVTEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDVTTFVRGKIQ----------------------------  120

Query  149  HRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIK  222
                                                                                      
Sbjct  121  --------------------------------------------------------------------------  120

Query  223  VSTRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYR  296
                                                                                      
Sbjct  121  --------------------------------------------------------------------------  120

Query  297  ALFRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPL  370
                                                                     |||||||||.|||||||
Sbjct  121  ---------------------------------------------------------VTIVEKADSCSVLPSPL  137

Query  371  SISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  SISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSRIYSDKEFSGSCNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD  211

Query  445  GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPE  518
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  GERPFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPE  285

Query  519  SMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAF  592
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  SMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEGLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAF  359

Query  593  RNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQD  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  RNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQD  433

Query  667  LGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  LGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDS  507

Query  741  VTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVR  814
            ||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  VTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVGPYPAVDIFRLIGTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVR  581

Query  815  TIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSD  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  582  TIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFVLLFPWACGTHSD  655

Query  889  VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDITP  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  656  VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSCDQDEPDSAFEATQYFFEDITP  729

Query  963  ECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTM  1036
            |||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  730  ECTHVVGLDSRGKQSADDGFVTVSLKQDRGKRANSQENRNYLKLWTAENKSKSKTAKDLPKLNQGQFIELCKTM  803

Query 1037  YNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESV  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||  ....||.|.|.|||.||||||..|.|||||.
Sbjct  804  YNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKFFITQPAKE--DAVPGPPCGQAIPGMLFPKKGSSQSYVVEST  875

Query 1111  EPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIG  1184
            |||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  EPLTASLAVDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIG  949

Query 1185  EDTVLVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASD  1258
            ||||||||.||.|.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  950  EDTVLVRSSQGRATLPRSSSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVRYFDKPVCMMARVTSAKNIRMMGKPLTSASD  1023

Query 1259  YEISAMSG  1266
            |||||.||
Sbjct 1024  YEISALSG  1031