Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07846
Subject:
NM_001163450.1
Aligned Length:
1337
Identities:
1223
Gaps:
32

Alignment

Query    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74

Query   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRKQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148

Query  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGNSQTESSLPGR-RKERPTSLNVFPLADGTVRAQ  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||| ||||||||||||||||     
Sbjct  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGSGQTESSLPGRSRKERPTSLNVFPLADG-----  217

Query  222  IGGKLVPAGDHWHLSDLGQLQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPL  295
                                      .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  --------------------------MCPNDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPL  265

Query  296  GDYGVGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLDRTGSSPTQG  369
            |||....||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  266  GDYVSVTKNNKQAREKRNSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDVCPETRLERTGSSPTQG  339

Query  370  IVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKND  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  IVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKND  413

Query  444  LIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPM  517
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||.||||||||||.|||||
Sbjct  414  LIAKVDQLSGEQEVLKGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAVTARREPREEVEDVSSYLCTELDKIPM  487

Query  518  AQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKR  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  AQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKR  561

Query  592  PYPSVNIHYKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACG  665
            .||||||||||||.|||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  SYPSVNIHYKSPTAAGFSQRRSHALCQISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACG  635

Query  666  WSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAPGRDPLT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|.|.|..||.||.|||||||
Sbjct  636  WSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPSTKLWCAAGVNLSGWKPHEEDSSNGPKPVPGRDPLT  709

Query  740  CDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSI  813
            |||||.|||||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  710  CDREGEGEPKSTHPSPEKKKAKETPEADATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTIVDQFTVCNAHVLCISSI  783

Query  814  PAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVN  887
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  784  PAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDSGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGDVATTANGKVN  857

Query  888  PSQSTEEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDPT  961
            |||||||||||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||..||.||||.|.......|..||||...
Sbjct  858  PSQSTEEATEATEVPDPGPSESEATTVRPGPLTEHVFTDPAPTPSSSTQPASENGSESNGTIVQPQVEPSGELS  931

Query  962  GAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS  1035
            ...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  TTTSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS  1005

Query 1036  NYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDS  1109
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  NYHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDS  1079

Query 1110  TLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLL  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  TLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAGNRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLL  1153

Query 1184  GLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSV  1257
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  GLRANKTSPTSGEGTRPGGIIHVYGDDSSDKAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSV  1227

Query 1258  LDSPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQV  1331
            ||||.|||||||||...|||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||..|.||.||||||||||||||
Sbjct 1228  LDSPSEGPGPAAPAADAEGQKLKNALVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEECAGDVNQTKPSLSKAERSHIIVWQV  1301

Query 1332  SYTPE  1336
            |||||
Sbjct 1302  SYTPE  1306