Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07846
Subject:
NM_001163451.1
Aligned Length:
1336
Identities:
1223
Gaps:
31

Alignment

Query    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74

Query   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRKQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148

Query  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGNSQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADGTVRAQI  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGSGQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADG------  216

Query  223  GGKLVPAGDHWHLSDLGQLQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLG  296
                                     .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  -------------------------MCPNDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLG  265

Query  297  DYGVGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLDRTGSSPTQGI  370
            ||....||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct  266  DYVSVTKNNKQAREKRNSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDVCPETRLERTGSSPTQGI  339

Query  371  VNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  VNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDL  413

Query  445  IAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMA  518
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||.||||||||||.||||||
Sbjct  414  IAKVDQLSGEQEVLKGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAVTARREPREEVEDVSSYLCTELDKIPMA  487

Query  519  QRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRP  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  488  QRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRS  561

Query  593  YPSVNIHYKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACGW  666
            ||||||||||||.|||||||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  YPSVNIHYKSPTAAGFSQRRSHALCQISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACGW  635

Query  667  SLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAPGRDPLTC  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|.|.|..||.||.||||||||
Sbjct  636  SLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPSTKLWCAAGVNLSGWKPHEEDSSNGPKPVPGRDPLTC  709

Query  741  DREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIP  814
            ||||.|||||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  710  DREGEGEPKSTHPSPEKKKAKETPEADATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTIVDQFTVCNAHVLCISSIP  783

Query  815  AASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNP  888
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  784  AASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDSGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGDVATTANGKVNP  857

Query  889  SQSTEEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDPTG  962
            ||||||||||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||..||.||||.|.......|..||||....
Sbjct  858  SQSTEEATEATEVPDPGPSESEATTVRPGPLTEHVFTDPAPTPSSSTQPASENGSESNGTIVQPQVEPSGELST  931

Query  963  AGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLSN  1036
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  TTSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLSN  1005

Query 1037  YHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDST  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  YHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDST  1079

Query 1111  LRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLG  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  LRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAGNRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLG  1153

Query 1185  LRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVL  1258
            |||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  LRANKTSPTSGEGTRPGGIIHVYGDDSSDKAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVL  1227

Query 1259  DSPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQVS  1332
            |||.|||||||||...|||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||..|.||.|||||||||||||||
Sbjct 1228  DSPSEGPGPAAPAADAEGQKLKNALVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEECAGDVNQTKPSLSKAERSHIIVWQVS  1301

Query 1333  YTPE  1336
            ||||
Sbjct 1302  YTPE  1305