Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07846
• Subject: XM_024450211.1
• Aligned Length: 4158
• Identities: 3247
• Gaps: 909

Alignment

Query    1  ATGATGGAGATCCAGATGGACGAGGGCGGCGGCGTGGTGGTGTACCAGGACGACTACTGCTCCGGCTCGGTGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCGGAGCGGGTGTCGGGCCTGGCGGGCTCCATCTACCGCGAGTTCGAGCGCCTCATCCACTGCTACGACGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTGGTCAAGGAGCTCATGCCGCTGGTGGTGAACGTGCTGGAGAACCTAGACTCGGTGCTCAGCGAGAACCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGCACGAGGTGGAGCTGGAGCTGCTGCGCGAGGACAACGAGCAGCTGCTCACCCAGTACGAGCGTGAGAAGGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCTGCGCAGGCAGGCGGAGGAGAAATTCATTGAGTTTGAAGATGCTCTGGAACAAGAGAAGAAAGAGCTGCAAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCCAGGTGGAGCACTACGAGTTCCAGACGCGCCAGCTGGAGCTGAAGGCCAAGAACTATGCCGATCAGATTTCC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CGGTTGGAGGAGCGGGAGTCGGAGATGAAGAAGGAGTACAATGCCCTGCACCAGCGGCACACAGAGATGATACA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GACCTACGTGGAGCACATTGAGAGGTCCAAGATGCAGCAGGTCGGAGGAAACAGCCAGACCGAGAGCAGCCTGC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  CGGGGCGGAGGAAGGAGCGCCCCACCTCCCTGAACGTGTTCCCCCTGGCTGACGGCACGGTACGTGCACAGATC  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  GGGGGCAAGCTCGTGCCTGCGGGGGACCACTGGCACCTGAGTGACCTCGGCCAGCTGCAGTCCAGCTCCAGCTA  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  CCAGTGTCCACAGGATGAAATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGGCCGCCACACCCAGCACCACAGGCACCA  814
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGGCCGCCACACCCAGCACCACAGGCACCA  55

Query  815  AGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCCCTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTGGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  AGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCCCTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTGGGG  129

Query  889  GACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCGCGACAGCCGCAACATGGAAGTACAGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130  GACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCGCGACAGCCGCAACATGGAAGTACAGGT  203

Query  963  CACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACGAGTGGTCTGATGTTCAAGACATTATTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  CACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACGAGTGGTCTGATGTTCAAGACATTATTG  277

Query 1037  ACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGCACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  ACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGCACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGCATC  351

Query 1111  GTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCTGTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCATCGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  GTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCTGTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCATCGG  425

Query 1185  GGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCAGTGCGCGATGATTTCTTTGGAATGGGCAAAGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  GGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCAGTGCGCGATGATTTCTTTGGAATGGGCAAAGAAG  499

Query 1259  TGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAACGCCTTGAATGTGGTGAAGAATGACCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  TGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAACGCCTTGAATGTGGTGAAGAATGACCTG  573

Query 1333  ATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGGCGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGCCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  ATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGGCGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGCCAA  647

Query 1407  AGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAAGAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  AGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAAGAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCGCCC  721

Query 1481  GCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGATGTAAGCAGCTATCTCTGTACAGAATCGGACAAAATCCCCATGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  GCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGATGTAAGCAGCTATCTCTGTACAGAATCGGACAAAATCCCCATGGCC  795

Query 1555  CAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGAGCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCTGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  CAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGAGCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCTGAT  869

Query 1629  GGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCCGAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGAAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCCGAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGAAGA  943

Query 1703  AGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCCTCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGCCCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  AGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCCTCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGCCCC  1017

Query 1777  TATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTTCAGCCAGCGCCGCAACCATGCCATGTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  TATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTTCAGCCAGCGCCGCAACCATGCCATGTG  1091

Query 1851  CCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACGACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAGAGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACGACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAGAGC  1165

Query 1925  AGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGACGACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGCTGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  AGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGACGACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGCTGG  1239

Query 1999  AGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGAGGACACGCGGATGAAGAACGTGCCGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  AGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGAGGACACGCGGATGAAGAACGTGCCGGT  1313

Query 2073  GCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGCTGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACCTGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  GCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGCTGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACCTGA  1387

Query 2147  GCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCAGCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACCTGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  GCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCAGCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACCTGC  1461

Query 2221  GACCGAGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGAGAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCCTGA  2294
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  GACCGCGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGAGAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCCTGA  1535

Query 2295  AATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGACCACCAGCAAGGTGGTGATCATCGACG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536  AATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGACCACCAGCAAGGTGGTGATCATCGACG  1609

Query 2369  CCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCGCACGTGCTGTGCATCTCCAGCATCCCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  CCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCGCACGTGCTGTGCATCTCCAGCATCCCC  1683

Query 2443  GCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAGCGACGTGAACCCAGAGGACCCGGGCGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  GCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAGCGACGTGAACCCAGAGGACCCGGGCGC  1757

Query 2517  AGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCTGCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCTCCT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758  AGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCTGCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCTCCT  1831

Query 2591  CCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCCACCATCGCCAACGGGAAGGTCAACCCG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832  CCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCCACCATCGCCAACGGGAAGGTCAACCCG  1905

Query 2665  TCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCCTGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGCCAC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906  TCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCCTGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGCCAC  1979

Query 2739  ATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCCCGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGCCTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980  ATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCCCGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGCCTG  2053

Query 2813  GCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAGCCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACGGGA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  GCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAGCCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACGGGA  2127

Query 2887  GCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGGCTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGTGGC  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128  GCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGGCTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGTGGC  2201

Query 2961  CAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGCTGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCCGTG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202  CAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGCTGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCCGTG  2275

Query 3035  TGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGTGAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGCAAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276  TGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGTGAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGCAAC  2349

Query 3109  TATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCATGGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTGGTG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350  TATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCATGGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTGGTG  2423

Query 3183  TGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGATAGAGAAGTCATTTGACGCCCACCCGC  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424  TGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGATAGAGAAGTCATTTGACGCCCACCCGC  2497

Query 3257  GGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTATGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCCACC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498  GGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTATGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCCACC  2571

Query 3331  CTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGACATTGAGCCCTACGTCAGCAAGATGCT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572  CTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGACATTGAGCCCTACGTCAGCAAGATGCT  2645

Query 3405  AGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGCTTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGGTGG  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646  AGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGCTTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGGTGG  2719

Query 3479  GCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGA--------------------------------  3520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct 2720  GCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGAGTGAGTGGCCTGCACACCTGCAGGGGCAGTGG  2793

Query 3521  --------------------------------------------------------------------------  3520
                                                                                      
Sbjct 2794  TGCTGCCAGAGGTGTACGTGGGTTCACGGGGTGGCTCTGCAGGGCCACCTTGGAGGGTGCCTTGCTGCCCCTAC  2867

Query 3521  --------------------------------------------CTGTGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCCTGG  3550
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868  GCTGACCGCTCTCCTCTTCTCCCATGCTCCTCCCATGTCCCCAGCTGTGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCCTGG  2941

Query 3551  GGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGTCCCGGGGGCATCATCCACGTGTATGGC  3624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942  GGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGTCCCGGGGGCATCATCCACGTGTATGGC  3015

Query 3625  GATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTCCATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTTCCA  3698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3016  GATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTCCATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTTCCA  3089

Query 3699  TGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACGTGCTGGCCACCCTGAATGGCAGTGTGC  3772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3090  TGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACGTGCTGGCCACCCTGAATGGGAGTGTGC  3163

Query 3773  TGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAGGTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAACGTG  3846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164  TGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAGGTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAACGTG  3237

Query 3847  CTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGACGGAGAGGACGACGAGACGGAGGAGGG  3920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238  CTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGACGGAGAGGACGACGAGACGGAGGAGGG  3311

Query 3921  CGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGCGCAGTCACATCATCGTGTGGCAGGTGT  3994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3312  CGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGCGCAGTCACATCATCGTGTGGCAGGTGT  3385

Query 3995  CCTACACCCCCGAG  4008
            ||||||||||||||
Sbjct 3386  CCTACACCCCCGAG  3399