Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- NM_001277293.1
- Aligned Length:
- 1140
- Identities:
- 995
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ------MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTV 68
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Sbjct 1 MPGWKKNIPI-----CLQAEEQERDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTV 69
Query 69 SGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQ 142
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Sbjct 70 SGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQ 143
Query 143 GSSVIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTH 216
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Sbjct 144 GSSVMFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTH 217
Query 217 AEAMSILKQCGQEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIAD 290
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Sbjct 218 AEAMSILKQCGQEATLLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSVCCNKQVIVIDKIKSASIAD 291
Query 291 RCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHA---------------- 348
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Sbjct 292 RCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQHPWDAWAS 365
Query 349 ------------------------------------ALVSSSFSPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTM 386
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Sbjct 366 NQCGVHTNHHHNTYHPDHCRVPALTFPKALPPNSPPAMVPSS-SPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTM 438
Query 387 MRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPA 460
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Sbjct 439 MRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPA 512
Query 461 ERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGI 534
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Sbjct 513 ERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEANQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHSVELGI 586
Query 535 TISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDN 608
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Sbjct 587 TISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDN 660
Query 609 SDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLS 682
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Sbjct 661 SDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLS 734
Query 683 EAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDS 756
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Sbjct 735 EAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPIPGHSGDLGDGEEDPSPIQKPGKLSDAYPSTVPSVDSAVDS 808
Query 757 WDGSAIDTSYGTEGTSFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTYPDVGLSYEDWDRSTASGFAGAADSA 830
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Sbjct 809 WDGSGIDASYGSQGSTFQTSGYNYNTYDWRSPKQRTSLSPVPKPRSQTYPDVGLSNEDWDRSTASGFVGASDSA 882
Query 831 ETEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQE 904
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Sbjct 883 DAEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELE---------------ATIMSGSTMSLNHEAPMARSQLGRQASFQE 941
Query 905 RSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVY 978
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Sbjct 942 RSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSGMEDFGFSVADGLLEKGVY 1015
Query 979 VKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSE 1052
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Sbjct 1016 VKNIRPAGPGDVGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIEQPALPSDWSE 1089
Query 1053 QNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL------ 1076
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Sbjct 1090 QNSAFFQQPSHG------IPGDTVYFWQSL 1113