Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- NM_001277294.1
- Aligned Length:
- 3228
- Identities:
- 2838
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA 74
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACCAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA 74
Query 75 ATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG 148
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG 148
Query 149 GCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAG 222
||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 GCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAA 222
Query 223 GATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGA 296
|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGA 296
Query 297 CTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATG 370
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 297 CTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATG 370
Query 371 TGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTC 444
|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTC 444
Query 445 CGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGA 518
|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGA 518
Query 519 TAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCA 592
.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 CAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCA 592
Query 593 AACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATT 666
||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 593 AACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATC 666
Query 667 CTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGC 740
||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 CTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGC 740
Query 741 ATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGT 814
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 741 ATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGT 814
Query 815 GCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCAT 888
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 815 GCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACAC 888
Query 889 GTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCT 962
||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 GTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCT 962
Query 963 GGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCG 1036
||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 963 GGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTG 1036
Query 1037 ACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATG 1110
|||||||.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATG 1107
Query 1111 GGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA 1184
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA 1181
Query 1185 CTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAG 1258
|||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1182 CTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAG 1255
Query 1259 AGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACT 1332
||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1256 AGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACG 1329
Query 1333 CTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGG 1406
|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1330 CTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGG 1403
Query 1407 AGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAG 1480
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..|||
Sbjct 1404 AGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAG 1477
Query 1481 ACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA 1554
|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 ACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA 1551
Query 1555 ACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAA 1628
||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1552 ACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAA 1625
Query 1629 ACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTG 1702
|||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1626 ACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGG 1699
Query 1703 GGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAG 1776
|.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1700 GAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAG 1773
Query 1777 CAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGC 1850
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774 CAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGC 1847
Query 1851 AATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGT 1924
.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1848 GATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGT 1921
Query 1925 TTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGAC 1998
||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1922 TTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGAT 1995
Query 1999 CGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGC 2072
.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 1996 AGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGC 2069
Query 2073 AGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTA 2146
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2070 AGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCA 2143
Query 2147 TTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCC 2220
|..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2144 TCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCC 2217
Query 2221 GACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAG 2294
||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||
Sbjct 2218 GATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAG 2291
Query 2295 CTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAAC 2368
||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2292 CTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGC 2365
Query 2369 AGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGAC 2442
|.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 2366 AAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGAC 2439
Query 2443 TGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTG 2516
|||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2440 TGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTG 2513
Query 2517 GTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACA 2590
|||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 2514 GTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGA-------------- 2573
Query 2591 GGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAG 2664
|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2574 -------------------------------GGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAG 2616
Query 2665 GCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAG 2738
|||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 2617 GCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAG 2690
Query 2739 CCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAG 2812
||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 2691 CCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAG 2764
Query 2813 AAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAG 2886
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 2765 AAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAG 2838
Query 2887 GACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCC 2960
|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2839 GACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCC 2912
Query 2961 AGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACT 3034
|||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2913 AGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACT 2986
Query 3035 GCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCT 3108
|||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2987 GCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCC 3060
Query 3109 TCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCC 3182
||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 3061 TCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACC 3134
Query 3183 TAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA 3228
.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3135 CAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA 3180