Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- NM_028736.2
- Aligned Length:
- 3384
- Identities:
- 2881
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA 74
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACCAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA 74
Query 75 ATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG 148
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG 148
Query 149 GCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAG 222
||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 GCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAA 222
Query 223 GATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGA 296
|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGA 296
Query 297 CTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATG 370
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 297 CTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATG 370
Query 371 TGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTC 444
|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTC 444
Query 445 CGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGA 518
|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGA 518
Query 519 TAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCA 592
.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 CAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCA 592
Query 593 AACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATT 666
||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 593 AACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATC 666
Query 667 CTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGC 740
||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 CTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGC 740
Query 741 ATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGT 814
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 741 ATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGT 814
Query 815 GCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCAT 888
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 815 GCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACAC 888
Query 889 GTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCT 962
||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 GTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCT 962
Query 963 GGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCG 1036
||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 963 GGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTG 1036
Query 1037 ACCATG-------------------------------------------------------------------- 1042
||||||
Sbjct 1037 ACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGTTCAT 1110
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1111 ACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCC 1184
Query 1043 --------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCC 1102
|.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185 TCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCC 1255
Query 1103 TGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAA 1176
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 TGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAA 1329
Query 1177 AAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGA 1250
|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1330 AAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGA 1403
Query 1251 AACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCA 1324
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 AACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCA 1477
Query 1325 CAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTA 1398
||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1478 CAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTA 1551
Query 1399 CAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCT 1472
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||
Sbjct 1552 CAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACT 1625
Query 1473 CCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAA 1546
|||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAA 1699
Query 1547 GTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCC 1620
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1700 GTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCC 1773
Query 1621 AGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCT 1694
|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1774 AGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCT 1847
Query 1695 GGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGA 1768
||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1848 GGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGA 1921
Query 1769 TCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGT 1842
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1922 TCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGT 1995
Query 1843 TCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGA 1916
||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1996 TCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGA 2069
Query 1917 AGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACA 1990
||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2070 AGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACA 2143
Query 1991 TAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTA 2064
|.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 2144 TCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTC 2217
Query 2065 CAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAA 2138
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2218 CAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAA 2291
Query 2139 GTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCA 2212
||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||
Sbjct 2292 GTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCA 2365
Query 2213 AGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATA 2286
||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct 2366 AGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATA 2439
Query 2287 GACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAG 2360
||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 2440 GATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAG 2513
Query 2361 TCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTT 2434
||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 2514 TCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTA 2587
Query 2435 ATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAG 2508
|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.
Sbjct 2588 ATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAA 2661
Query 2509 AACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAA 2582
|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 2662 AACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAA 2735
Query 2583 AGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGA 2656
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2736 AGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGA 2809
Query 2657 ATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCG 2730
|||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2810 ATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCA 2883
Query 2731 CACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAAT 2804
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct 2884 CACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAAT 2957
Query 2805 GAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTG 2878
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2958 GAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTG 3031
Query 2879 ACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCA 2952
.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3032 GCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCA 3105
Query 2953 GCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGA 3026
|||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 3106 GCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGA 3179
Query 3027 CTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACC 3100
|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 3180 CTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATC 3253
Query 3101 CACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTC 3174
|||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3254 CACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTC 3327
Query 3175 CAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA 3228
|||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3328 CAGCAACCCAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA 3381