Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07882
- Subject:
- NM_130891.2
- Aligned Length:
- 3228
- Identities:
- 2760
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA 74
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACCAA--------------------- 53
Query 75 ATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG 148
||||||||||||||
Sbjct 54 ------------------------------------------------------------AGAGGAATTCAAGG 67
Query 149 GCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAG 222
||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 68 GCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAA 141
Query 223 GATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGA 296
|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 142 GATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGA 215
Query 297 CTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATG 370
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 216 CTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATG 289
Query 371 TGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTC 444
|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 290 TCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTC 363
Query 445 CGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGA 518
|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 364 CGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGA 437
Query 519 TAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCA 592
.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 438 CAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCA 511
Query 593 AACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATT 666
||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 512 AACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATC 585
Query 667 CTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGC 740
||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 586 CTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGC 659
Query 741 ATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGT 814
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 660 ATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGT 733
Query 815 GCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCAT 888
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 734 GCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACAC 807
Query 889 GTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCT 962
||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 808 GTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCT 881
Query 963 GGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCG 1036
||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 882 GGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTG 955
Query 1037 ACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATG 1110
|||||||.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 956 ACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATG 1026
Query 1111 GGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA 1184
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA 1100
Query 1185 CTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAG 1258
|||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1101 CTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAG 1174
Query 1259 AGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACT 1332
||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1175 AGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACG 1248
Query 1333 CTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGG 1406
|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1249 CTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGG 1322
Query 1407 AGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAG 1480
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..|||
Sbjct 1323 AGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAG 1396
Query 1481 ACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA 1554
|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 ACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA 1470
Query 1555 ACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAA 1628
||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1471 ACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAA 1544
Query 1629 ACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTG 1702
|||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1545 ACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGG 1618
Query 1703 GGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAG 1776
|.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1619 GAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAG 1692
Query 1777 CAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGC 1850
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1693 CAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGC 1766
Query 1851 AATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGT 1924
.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1767 GATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGT 1840
Query 1925 TTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGAC 1998
||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1841 TTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGAT 1914
Query 1999 CGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGC 2072
.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 1915 AGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGC 1988
Query 2073 AGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTA 2146
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1989 AGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCA 2062
Query 2147 TTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCC 2220
|..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2063 TCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCC 2136
Query 2221 GACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAG 2294
||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||
Sbjct 2137 GATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAG 2210
Query 2295 CTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAAC 2368
||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2211 CTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGC 2284
Query 2369 AGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGAC 2442
|.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 2285 AAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGAC 2358
Query 2443 TGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTG 2516
|||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2359 TGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTG 2432
Query 2517 GTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACA 2590
|||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 2433 GTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGA-------------- 2492
Query 2591 GGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAG 2664
|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2493 -------------------------------GGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAG 2535
Query 2665 GCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAG 2738
|||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 2536 GCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAG 2609
Query 2739 CCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAG 2812
||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 2610 CCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAG 2683
Query 2813 AAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAG 2886
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 2684 AAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAG 2757
Query 2887 GACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCC 2960
|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2758 GACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCC 2831
Query 2961 AGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACT 3034
|||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2832 AGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACT 2905
Query 3035 GCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCT 3108
|||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2906 GCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCC 2979
Query 3109 TCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCC 3182
||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2980 TCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACC 3053
Query 3183 TAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA 3228
.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3054 CAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA 3099