Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07882
Subject:
NM_133442.2
Aligned Length:
3232
Identities:
2754
Gaps:
134

Alignment

Query    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGC--GACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACT  72
                                ||||||              |||  |        ||||.||             
Sbjct    1  --------------------ATGCCG--------------GGCTGG--------AAGAAGA-------------  19

Query   73  AAATCCGCCAGC--CAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTC  144
            |.|||| |||.|  |..|| ||||     |..|||||          ||||||          .||||||||||
Sbjct   20  ACATCC-CCATCTGCTTAC-AAGC-----GGAGGAGC----------AGGAGA----------GAGAGGAATTC  66

Query  145  AAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGA  218
            ||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct   67  AAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGA  140

Query  219  TAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG  292
            |||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  TAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG  214

Query  293  GTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAG  366
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct  215  GCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAA  288

Query  367  AATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTAT  440
            |||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  289  AATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTAT  362

Query  441  TTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATG  514
            .||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  363  GTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATG  436

Query  515  ATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACG  588
            ||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  437  ATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACC  510

Query  589  ATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAG  662
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct  511  ATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAG  584

Query  663  TATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAA  736
            .||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  585  CATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGA  658

Query  737  CAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCG  810
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  659  CAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCC  732

Query  811  ATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATT  884
            .|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct  733  GTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCT  806

Query  885  GCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGT  958
            .||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  807  ACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGT  880

Query  959  TCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGG  1032
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  881  TCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGC  954

Query 1033  CCCGACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAA  1106
            ||.||||||||.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  955  CCTGACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAA  1025

Query 1107  CATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGA  1180
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  CATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGA  1099

Query 1181  AAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACC  1254
            |||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1100  AAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACC  1173

Query 1255  ACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGA  1328
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1174  ACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGA  1247

Query 1329  AACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGA  1402
            .||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1248  GACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGA  1321

Query 1403  TTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTC  1476
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.
Sbjct 1322  TTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTG  1395

Query 1477  CGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAG  1550
            .||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  AGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAG  1469

Query 1551  TGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTA  1624
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1470  TGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTA  1543

Query 1625  GAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAA  1698
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1544  GAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAA  1617

Query 1699  CTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCT  1772
            ||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1618  CTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCT  1691

Query 1773  CCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCG  1846
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1692  CCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCG  1765

Query 1847  GAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAG  1920
            ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1766  GAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAG  1839

Query 1921  CCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGG  1994
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1840  CCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGG  1913

Query 1995  AGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGA  2068
            |||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 1914  AGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGA  1987

Query 2069  TGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTC  2142
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1988  TGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTC  2061

Query 2143  CCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCT  2216
            ||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||
Sbjct 2062  CCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCT  2135

Query 2217  CTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACA  2290
            ||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..
Sbjct 2136  CTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATG  2209

Query 2291  CCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCA  2364
            ||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2210  CCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCA  2283

Query 2365  AAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGA  2438
            ||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 2284  AAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGA  2357

Query 2439  AGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACT  2512
            |||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 2358  AGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACT  2431

Query 2513  TCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCT  2586
            |||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||          
Sbjct 2432  TCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGA----------  2495

Query 2587  GACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCA  2660
                                               |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2496  -----------------------------------GGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCA  2534

Query 2661  TGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACT  2734
            |||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 2535  TGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACT  2608

Query 2735  ACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAA  2808
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.
Sbjct 2609  ATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAG  2682

Query 2809  CAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACAT  2882
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 2683  CAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCAT  2756

Query 2883  GGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTG  2956
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2757  GGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTG  2830

Query 2957  GGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTT  3030
            |||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2831  GGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTT  2904

Query 3031  GACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACT  3104
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2905  GACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACT  2978

Query 3105  GGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGC  3178
            |||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2979  GGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGC  3052

Query 3179  AGCCTAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA  3228
            |.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3053  AACCCAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA  3102